Содержание

У рыбок данио-рерио нашли способность предаваться отчаянию — Наука

ЕКАТЕРИНБУРГ, 29 мая. /ТАСС/. Биологи выяснили, что у рыбок данио-рерио, как и у млекопитающих, может проявляться поведение, подобное человеческому отчаянию. При этом рыбок можно успокоить с помощью антидепрессантов. Благодаря этому открытию ученые смогут тестировать подобные препараты не только на грызунах, как раньше, но и на данио-рерио. Результаты исследования опубликовал Journal of Neuroscience Methods, кратко об этом пишет пресс-служба Уральского федерального университета (УрФУ).

«Учитывая, что генетически рыбы и люди подобны друг другу на 70%, мы сделали поиск потенциальных биологических мишеней для антидепрессантов гораздо менее сложным и менее дорогим, чем при работе с грызунами. Используя рыб данио-рерио, наука быстрее найдет, протестирует и отберет новые, более совершенные лекарственные препараты против депрессии», – рассказал руководитель исследования, ведущий научный сотрудник УрФУ Алан Калуев.

Данио-рерио (Danio rerio, также ее называют полосатым данио, зебраданио или дамским чулком) – это пресноводная рыбка до 4 см в длину, которую часто выращивают для аквариумов. Благодаря относительно сложной нервной системе, быстрому размножению и хорошей выживаемости эту рыбку часто используют в научных исследованиях.

В частности, благодаря этим рыбкам ученые выяснили, что быстрая и медленная фазы сна появились у позвоночных как минимум 450 млн лет назад, а также то, что антидепрессант флуоксетин может негативно действовать на их детей и внуков, снижая уровень гормона стресса – кортизола.

В новом исследовании ученые из России, Бразилии и Китая во главе с Аланом Калуевым тоже обратились к проблеме антидепрессантов. Ранее подобные препараты создавали и тестировали на лабораторных грызунах. Однако их выращивание делает эксперименты достаточно дорогими. Ученые решили проверить, можно ли проводить подобные испытания на более доступных животных.

Новая модель депрессии

Чтобы проверить, как антидепрессанты действуют на живой организм, ученые специально доводят их до состояния так называемой приобретенной беспомощности. В этом случае животное находится в неприятной ситуации, но не пытается из нее выйти даже в том случае, если может это сделать. С помощью этого состояния ученые моделируют депрессию и проверяют, могут ли разработанные ими препараты вывести животное из такой беспомощности.

Способы для того, чтобы ввести в такое состояние грызунов, специалисты разработали давно, а для данио-рерио их еще не было. Калуев и его коллеги для этого предложили подвешивать рыбку за хвост. Исследователи закрепляли хвост данио-рерио в губчатом материале и опускали их в стакан под действием классических антидепрессантов – сертралина и амитриптилина. Кроме них ученые использовали низковольтный электрический ток, специальный феромон и феназепам.

Опыты показали, что после обездвиживания у данио-рерио действительно появлялось состояние, близкое к человеческому отчаянию. Сертралин и амитриптилин смогли помочь рыбкам, увеличив активность гормонов серотонина и дофамина в их мозгу. Таким образом, поскольку антидепрессанты действуют на данио-рерио практически так же, как на грызунов и людей, то этих рыбок можно использовать в испытаниях подобных препаратов. Таким образом их можно сделать гораздо дешевле и проводить быстрее.

Эксперименты привели не только к практическим, но и к фундаментальным результатам. «Мы «отодвинули» модель отчаяния, основанную на выученной беспомощности, на 340 млн лет: ведь первые челюстные рыбы появились в ходе эволюции 400 млн лет назад, а грызуны – 60 млн лет назад», – пояснил один из авторов исследования, старший научный сотрудник СПбГУ Константин Демин. Таким образом, отчаяние – один из симптомов депрессии – оказалось гораздо древнее, чем ученые думали ранее. 

Поскольку у депрессии настолько древнее происхождение, мишени для ее лечения нужно искать в консервативных молекулярных механизмах, общих для рыб, грызунов и человека. А их не настолько много, заключил Алан Калуев.

Данио вишневый (2-3см)

Название: Данио вишневый Артикул: m127 Категория: Карповые Синонимы: Danio Cyprinidae Ареал: Родина рыбки в Азии, от Пакистана до Индии, а также в небольших количествах в Непале, Бангладеш и Бутане. Размеры: до 5см Различия полов: Самцы стройнее и ярче самки Содержание: Оптимальные параметры воды: 18-24°С, dGH 5-20°, рН 6-7,5. Аквариум от 30л, с зарослями растений и свободным местом для плавания. Рыбки мирные, неприхотливые, подвижные, стайные — рекомендуется держать группкой от 8-10 особей. Аквариум обязательно закрывать крышкой, поскольку рыбки прыгучие. Кормление: Данио «Вишня» употребляют в пищу живой , замороженный корм не очень крупных размеров, такой как мелкий мотыль, артемию, коретру, циклоп, дафнию, а также сухой корм- мелкие гранулы и хлопья, но при этом предпочитают брать корм с поверхности воды, реже в середины и никогда с дна. Разведение: Развести рыбу данио несложно. Нерестится данио в неволе хорошо, если соблюдаются правильные условия содержания рыбок. Температура воды в аквариуме должна быть оптимальной — 20-24С. В неволе самки дают от 50 до 300 икринок за один нерест. На дно нерестовика кладут мох или блестянку. Их прижимают камешками, чтобы не поднимались на поверхность воды. Очень важно, чтобы дно банки было выпуклым в середине. Нерестовик заливают отстоянной водой на 7-10 см. Воду отстаивают в течение 6-7 дней. В банку помещают двух самцов и самку. Обычно, это делают вечером. Нереститься самка начинает с первыми лучами утреннего солнца. Совместимость: Отличная рыбка для общего аквариума. Содержать можно с любыми некрупными и мирными рыбками, такими, как неоны и большинство харациновых, петушки, гуппи, пецилии, мелкие радужницы, расборы, лабео, меченосцы, боции и моллинезии, Не следует сажать их с барбусами, а также с крупными и хищными рыбами. При содержании стайками от 5 штук в общем аквариуме «Вишня» наиболее активны и наименее подвержены стрессу. Оформление аквариума: Эти рыбки живут практически в любых вариантах оформленных аквариумов, но предпочитают густо засаженные пространства. Для оформления аквариумов можно использовать мхи, длинностебельные растения, анубиасы и тд., т.к. данио не повреждают растения.

Аквариумные рыбки Данио — содержание, уход, разнообразие видов

Данио – маленькие рыбки из семейства карповых. Эти создания водятся в теплых стоячих реках Азии. Они живут и размножаются даже на полях, где выращивают рис.

Данио — рыба имеет плоское узкое тело, в природных условиях они вырастают до 1,5 дм. В стеклянном аквариуме их размеры – вдвое меньше. Эти рыбки приобрели популярность за яркий и разнообразный окрас. Они бывают всех цветов радуги. Отдельные  виды украшены усами. Их пищей в природе является планктон. Аквариумные рыбки данио едят любой корм.

Данио передвигаются даже в аквариуме стайками. Это не агрессивные игривые создания. Данио самец немного мельче самки. Спаривание возможно между разными видами. Самки мечут икру в возрасте 5-11 месяцев. В содержании эти рыбки неприхотливы, поэтому их успешно успешно содержат и разводят дома и начинающие, и опытные  аквариумисты.

Многих любителей интересует вопрос – сколько живут в неволе рыбки данио? Ответ – от 2 до 6 лет.

 Характеристика различных видов аквариумных рыбок данио

 Жемчужный данио

Родина этого вида — страны Восточной Азии. Они водятся в мелководных протоках, на рисовых плантациях. Полупрозрачное перламутровое тело украшено усиками и алой полоской, которая переходит на хвост. Плавники имеют желтовато — зеленый отлив.

 

Данио хопра (светлячок)

Данио светлячок получил имя за желто – оранжевый окрас. На спинке крошечной рыбки – радужные плавники.  Длина данио хопра – всего 3 см. Тело украшено яркими полосками. В природе эта разновидность обитает в реке Ировади. Рот расположен на верхней части  головы. Маленькая рыбка хорошо прыгает над поверхностью водоема. Живет данио хопра 3 года.

Малабарский данио

Малабарский данио водится в Индии и на о. Цейлон. Блестящая серебристая чешуя украшена разноцветными полосами по телу. Жабры отмечены яркими желтыми пятнами. Рыбка играет всеми цветами радуги. Нижние плавники розовые, а верхние – спинной и хвостовой – синие. Тело самки крупнее в брюшке. Длина рыбки – 10-12 см.

Самка мечет икру всего несколько часов. За это время из нее выходит до 2 тысяч икринок. Половой зрелости самка достигает примерно через год.

Данио рерио

Данио рерио живут в воде + 20-23С. Они хорошо соседствуют в одной воде со многими видами мелких аквариумных рыбок. Длина тела – 4-5 см, форма – плоская, удлиненная. Привлекают внимание яркие синие и светлые разводы от головы до хвостового плавника.  Для стайки рерио в 6 рыбок надо иметь емкость объемом не меньше 20 л. Они должны свободно плавать. Излишне декорированный водорослями и камнями аквариум будет им тесен.

Правила содержания

Для хорошей выживаемости и размножения рыбок данио следует предоставить им такие условия, которые бы напоминали родные воды  рек Азии. Теплую воду частично  еженедельно надо обновлять. Кормить данио надо разнообразной и сбалансированной пищей, как и всех других обитателей аквариума. В рацион надо включать и сухие кормовые смеси, так и живой корм. Существуют корма с добавками для рыбок определенного

Глофиш – это специально выведенный вид данио, имеющих флуоресцентный красный, зеленый, оранжевый окрас.  При определенных мутациях миролюбивый характер рыбок не изменился. Они так же не потеряли способности к размножению.

Рерио – первые флюоресцентные рыбки. Они светятся в темноте при попадании небольшого света на них.

Как получили светящихся рыбок?

В ген данио рерио вживили клетки светящейся медузы Aequorea Victoria. Получилась аквариумная рыбка данио яркого зеленого цвета. В США модифицированный вид использовали для определения чистоты водоемов. В грязной воде окрас рыбок изменялся.

Специалисты, разводящие аквариумных рыбок, заказали ученым выведение красной рыбки. К геному рерио добавили ДНК красного коралла, и получили красную светящуюся рыбку данио коралловый. Первая генетически  модифицированная рыбка появилась в 2003 году.

Глофиш предпочитают более теплую среду обитания. В европейских странах запрещен ввоз и продажа генетически модифицированных рыбок.

Данио красный

Вид, выведенный недавно генетиками в Азии. Окрас получен без применения красителей, он получен с помощью генной инженерии и передается потомкам.

Данио розовый

Это один из самых ярких видов данио. Специальный корм может сделать окрас ярче и сочнее. Данио розовый — рыбка 4,5 см в длину, плоское тело яркого розового цвета украшают белые узкие полоски. Условия содержания и нереста не отличаются от содержания других данио. Родина – о. Суматра и Таиланд.

Голубой данио или Керра

Обитает в природе на островах Сиамского залива. Рыбка совсем маленькая – 4-5 см, тело ее почти просвечивается, имеет отростки — усики. Синеватый цвет с серебристым свечением во время икромета становится ярче. По спинке тянуться две желтые полосы. Прозрачные плавники имеют зеленоватый отлив. Самочки – более крупные сероватого оттенка. В природе данио голубой   обитают в мелких прозрачных ручьях.

Данио вишневый

Модифицированный вид данио, обладает красным или ярко – розовым цветом тела. Длина – 5 см. Данио «вишня» имеет желтоватые полоски вдоль тела. В аквариуме эти рыбки могут жить до 4-х лет. Кормить рыбок следует свежим или замороженным мелким мотылем, коретрой, циклопами. Можно сыпать и сухой корм.

Надо помнить! Корм дается в небольших количествах. Рыбки предпочитают брать его с поверхности воды, но никогда не подберут еду, упавшую на дно.

Селекционные формы данио

Селекционеры по выведению новых видов аквариумных рыбок скрещивают особи разных видов и получают новые селекционные разновидности – леопардового окраса и с большими плавниками и хвостами.

Данио леопардовый считается гибридом Brachydanio rerio с Brachydanio nigrofasciatus. Похожий вид обитает в Индии. В Европу леопардовые данио завезены в середине 20 века. Удлиненное 5 — сантиметровое тело рыбки снабжено парой усиков. Основной тон окраса колеблется от белесого до золотисто – желтого. Название виду дали многочисленные темные пятна, которые на хвосте и плавниках переходят в полоски. Самец имеет более яркую расцветку.

В Пакистане и Бангладеш живут бенгальские данио. Они вдвое крупнее леопардовых. Они имеют салатовый оттенок с перламутровым блеском. Голубоватые и желтые полоски проходят по спине и хвосту. Этот вид имеет самый длинный плавник на спине из всех данио.

Данио тинвини – серебристо – голубая рыбка, чье тело и плавники покрывают золотистые колечки. Они делают ее очень яркой и заметной среди сородичей.

Микрорасбора «Галактика» — одна из самых ярких аквариумных рыбок. На синем фоне спинки и боков расположены ярко – желтые пятнышки. Они покрывают тело рыбки с головы до хвоста. Плавники, брюшко и хвост отмечены широкими оранжевыми полосами.

Данио вуалевый обладает красивыми большими плавниками и хвостом. Они прозрачные. Наиболее яркими из вуалевых можно выделить вуалевый розовый и леопардовый данио.

 Как разводить данио

Развести рыбу данио несложно. Нерестится данио в неволе хорошо, если соблюдаются правильные условия содержания рыбок. Температура воды в аквариуме должна быть оптимальной — +20-24С. В неволе самки дают от 50 до 300 икринок за один нерест. Размножение – нерест, надо подготовить.

Перед нерестом самок и самцов разделяют и хорошо кормят мотылем.  В качестве нерестовика можно использовать трехлитровую банку с выпуклым дном. На дно кладут мох или блестянку. Их прижимают камешками, чтобы не поднимались на поверхность воды. Очень важно, чтобы дно банки было выпуклым в середине. Нерестовик заливают отстоянной водой на 7-10 см. Воду отстаивают в течение 6-7 дней. В банку помещают двух самцов и самку. Обычно, это делают вечером. Нереститься самка начинает с первыми лучами утреннего солнца. Если этого не случилось в первый день, рыбок оставляют в нерестилище еще на сутки. Возможно, и на второй день ничего не произойдет. Тогда самку вынимают из воды, зажимают в мокрую ватку и икру выдавливают легким нажатием пальцев из ее брюшка. Вреда эта манипуляция рыбке не принесет, самка через несколько дней опять будет с икрой.

При естественном процессе нереста рыбки стремительно перемещаются в нерестилище, самцы толчками выбивают икру из брюшка самки. Икринки падают на дно под растения и становятся недоступны для поедания.

После выхода икринок рыбок убирают из банки, и ждут проклевывания личинок. Это происходит на 3-4 день после нереста. Их надо подкармливать инфузориями. Через 3 дня личинки помещают в большую емкость и начинают кормить циклопами. Вскоре личинки становятся мальками. Мальков разных видов надо выращивать отдельно. Более мелкие развиваются в общем аквариуме хуже.

Каким должен быть аквариум

Данио – стремительные рыбки, которые любят плавать. Они могут поместиться и в банке, но проживут там недолго и размножаться, наверняка, не станут. Самой подходящей формой аквариума будет вытянутый в длину сосуд водоизмещением не менее 50 л. Сверху аквариум надо закрывать, так как данио имеют способность выпрыгивать из воды.

На дно емкости надо положить мелкие камушки и поместить немного растений. Для свободного плаванья рыбок надо оставить свободный хорошо освещенный участок. Воду надо насыщать кислородом и частично подменивать 1 раз в неделю.

Рыбки данио могут стать украшением любого интерьера. Яркие цвета, неприхотливость в уходе привлекают аквариумистов к этому виду. Виды данио разнообразны – от крошечных данио хопра до 12 – сантиметрового малабарского.

Хорошо уживаются в аквариуме с данио рыбки семейства Харациновых – неоны. Они обитают в бразильских реках. Этот вид живет только в прозрачной воде.

 

Post Views: 8 419

Данио рерио — аквариумные рыбы

Семейство Карповые (Cyprinidae)

Среда обитания

В живой природе данио обитают в верхних слоях прибрежных стоячих водоемов или рек с медленным течением в Юго-Восточной Азии. Обычно эта рыбка плавает между стеблями водных растений или береговых трав, свешивающихся в воду. Здесь данио проще всего найти свою излюбленную добычу – мелких беспозвоночных. Здесь же рыбки нерестятся, откладывая икру в густых зарослях прибрежных растений.

Размеры и форма тела

Узкое тело данио рерио достигает около 5 см в длину. В уголках рта расположена пара маленьких усиков, направленных к низу. Самки отличаются от самцов более полным брюшком.

Окрас

Данио имеют оригинальную полосатую окраску. По всему телу, начинаясь у жаберных крышек, они чередуются от соломенно-желтого или желто-зеленого до черно-синего и переходят на хвостовой и анальный плавники. Наиболее широкие полосы на теле данио расположены в средней части туловища, особенно выражены они у самок. По направлению к голове и хвосту полоски становятся более узкими. Плавники данио имеют светлый желтый оттенок, а задний конец спинного плавника имеет темную полосу по краю.

Содержание в аквариуме

Данио рерио – одна из наиболее часто встречаемых в частных аквариумах рыб. Это очень подвижная и неприхотливая рыбка, способная комфортно жить даже в маленьком аквариуме. В 5-6-литровой емкости могут спокойно проживать 3-5 рыбок.
Как и в природных условиях, в аквариуме данио обычно держатся в средних и верхних слоях воды. Часто от испуга они могут выпрыгивать, и поэтому лучше накрывать аквариум плотной крышкой. Обычно данио держатся стайкой около 8-10 рыбок. Самцы данио постоянно игриво преследуют друг друга, быстро перемещаясь по аквариуму. Из-за того, что этим рыбкам нужно постоянно перемещаться, для них следует выбрать аквариум чуть вытянутый в длину. И также его лучше густно засадить по краям валлиснерией, сагиттарией, мириофиллумом, гелеохарисом, кабомбой и другими растениями. На стороне аквариума, с которой удобнее всего наблюдать за рыбками, стоит оставить свободную площадку, где рыбки смогут резвиться. Туда же следует давать им корм. Из-за густой растительности аквариум следует оборудовать хорошим освещением.

Требования

Данио крайне равнодушны к изменениям температуры воды, и легко переносят постепенное ее снижение до 15°C и повышение до 30°C. Однако для содержания производителей, а также для мальков рекомендуется температура 21–25°C. При дальнейшем нагревании аквариума способность рыбок к воспроизводству усиливается, но сильно снижается количества кислорода в воде, поэтому при такой температуре требуется регулярное сильное продувание аквариума. Для комфортного проживания данио необходима еженедельная подмена 10-15% объема воды. pH 6-7.5; dH 3-15°. Питается эта рыбка, в основном, некрупным живым и сухим кормом.

Размножение

Половое созревание у данео рерио наступает в 3-6 месяцев, учитывая срок жизни этих рыбок 2-3 года. Однако добиться нереста у них довольно сложно, хоть данио способны размножаться в любое время года. Для начала следует на несколько дней рассадить самцов и самок, поместив их в просторных аквариумах (от 10 литров) с температурой воды от 20 °C и обильно кормя мотылем или живыми красными дафниями. Готовность самки к нересту определяется по форме брюшка – при созревании икры оно становится сильно утолщенным не только в передней, но и в прилежащей к анальному плавнику части.
Непосредственно для нереста следует выбирать маленькие емкости, имеющие прозрачное стеклянное дно (например, стеклянные банки или аквариумы на 3-10 литров). Песок на дно лучше не класть, чтобы было удобно наблюдать за выметыванием и развитием икры. Если у выбранного сосуда плоское дно, то оно должно быть устлано хорошо промытым топняком или фонтиналисом, тщательно придавленным камешками. В банках или сосудах с вогнутым дном по наружному краю дна кольцом кладется мох, так же тщательно прижатые камнями. Нерестилище заполняют водой из чистого аквариума, пропущенной через сифон, либо свежей отстоявшейся водой. Уровень воды в нерестилище должен быть не менее 5-8 см, чтобы над мхом оставалось свободным пространство в 3-4 см. Сам сосуд лучше всего поставить на подоконник или вблизи окна. Производителей (обычно 2-3 самцов и одну самку) высаживают в нерестилище вечером.
Температура воды особого значения не имеет, но она не должна быть слишком низкой. За ночь рыбки привыкнут к новому «гнезду», а когда наутро нерестилище будет хорошо освещено, и растения начнут активно выделять кислород, должен начать нерест. Рыбки начинают двигаться очень стремительно, молниеносно носиться по аквариуму. Самцы преследуют самку, стараясь ударить ее в брюшко, выбивая икринки и выпуская на них молоки. Метки следуют одна за другой с перерывами не более 5 минут, и весь процесс обычно занимает около часа.
Количество выметанной икры от одной самки зависит от ее размеров и степени подготовленности к нересту, и достигает 400 икринок. После окончания метки следует отсадить самцов, но через 7-10 дней ее придется повторить, иначе икра перезреет, и мальков не получится. Бывает, что самка отказывается метать вообще, но обычно одна самка данио может дать 5-6 пометов подряд.

Иногда после посадки на нерест самка прячется и не реагирует на самцов. Это может означать, либо что икра недозрела, либо наоборот. Если брюшко не нерестящейся самки не слишком велико, ее лучше отсадить и несколько дней обильно кормить. У полной самки, отказавшейся метать, приходится выдавливать икру, обернув рыбку в мокрую вату и аккуратно надавливая пальцами. Если все выполнить правильно, через 4-5 дней самка наберет новую икру и может быть посажена на нерест снова. В обратном случае, когда самцы не начинают гона перед активной самкой в течение 2 дней, производителей следует отсадить в сосуд с более высокой температурой воды и усиленно кормить, пока они не начнут активно гоняться друг за другом.
Для того, чтобы икра не перезревала, в периоды между нерестами держать данио, предназначенных для меток, держать в воде температурой не более 17–19°C, кормя небольшим количеством корма.
Икра обычно созревает 30-36 часов при 26–28 °C, при более низких температурах созревание может занимать до 7 дней. Вылупившиеся мальки несколько дней висят, прикрепившись к растениям или стенкам аквариума, а затем понемногу начинают плавать. В первые дни мальков данио кормят инфузориями или «живой пылью», затем по мере роста их можно переводить на более крупный корм и переселять в более просторный аквариум. Оптимальная температура воды для хорошего развития молодняка данио – 26– 27 °C при обильном кормлении. Через 2,5-3 месяца в таких условиях рыбки достигают половой зрелости.

Модельные организмы: данио рерио

«Границы ключ переломлен пополам…» Многие морские водоемы из предыдущего выпуска нашего сериала по известным всем причинам оказались недоступными. Давайте погрузимся в пресную воду вместе с героиней очередного листа календаря — рыбкой данио рерио. В далекую доинтернетную эпоху каждый интересующийся биологией школьник нес домой в полиэтиленовом пакете аквариумных рыбок с птичьего рынка. Среди них были жители тропических Америк — пецилии, меченосцы, гуппи, — и азиаты — данио, барбусы, гурами. Никто не мог предполагать, что одна из этих декоративных рыбок уже через пару десятков лет будет полноправным участником исследований в биологии развития и нейронауках, помогать лечить болезни сердца и рак!

Привет! Меня зовут Сергей Мошковский. Дорогая редакция «Биомолекулы», выпустив настенный календарь о модельных организмах на 2020 год, заказала было мне лонгрид, который должен был, как суровый конвой, сопровождать календарь на сайте. Минутная слабость — сколько их было в жизни! — и я уже соглашаюсь. Но как писать? Ведь о каждой модельной скотинке, нарисованной на календаре, — как и о нескольких десятках не поместившихся туда, — написаны тома научной и даже популярной литературы. Придется писать не по-журналистски, из головы — как бы не вышло чего-то вроде поэмы «Москва — Петушки», где вместо станций — модельные организмы. Я и еще несколько авторов представляем вам на суд собранье пестрых глав — они будут выходить в течение всего 2020 года. Читатель, прости! Ты знаешь, кого за это винить!

Первая рыбка — моя! — Зебрафиш, или дамский чулок — Скоростное развитие — Рыбка лечит человека — Но у нее же нет легких!

Несмотря на многообразие костных рыб, больше двухсот лет основной биологической моделью из этой группы была знакомая многим золотая рыбка — одомашненная разновидность золотого карася (Carassius auratus). Она помогла сделать важные открытия в области биологии развития и иммунологии. На поле модельных рыбок были и есть и другие игроки, причем из разных отрядов лучеперых рыб. Среди них японская оризия, или медака, (Oryzias latipes) из отряда сарганообразные , трехиглая колюшка (Gasterosteus aculeatus) из скорпенообразных, зеленый меченосец (Xiphophorus hellerii) из карпозубообразных и прочие [1]. В 1960 году американский исследователь Джордж Стрейзингер, страстный поклонник тропических рыбок, выбрал новый объект для своих работ по изучению эмбрионального развития позвоночных [2]. Им оказалась обычная обитательница многих любительских аквариумов — рыбка данио рерио (Danio rerio), которая за свой полосатый окрас на английском называется zebrafish. Вообще с названиями на русском языке у этой рыбки дела не очень. Общепринятого названия у нее, похоже, так и не возникло. «Данио» и «данио рерио» звучат благозвучно, копируя латынь. На заре отечественной аквариумистики любители пытались придумать рыбке русское название. Получилось так себе — «дамский чулок». Наконец, в новейшей истории исследователи иногда называют этих рыбок неуклюжей калькой с английского — «зебрафиш» — и даже «зебраданио» по одному из вариантов латинского названия рода.

Новая экспериментальная модель далеко не сразу привлекла других исследователей, но сейчас, из-за нескольких удобных особенностей, о которых мы расскажем дальше, данио — одно из самых распространенных модельных животных. С помощью этих рыб исследуют развитие позвоночных, их иммунитет, физиологию, а также воздействие на эмбрионы и взрослых животных токсинов и лекарственных средств. Рыбки участвуют в опытах по исследованию поведенческих реакций в разных обстоятельствах. И, конечно, данио — прекрасный объект для генетических исследований, которые занимают особое место в жизни одного из соавторов этого материала.

Как же данио рерио освоил почти все ниши экспериментальной биологии? Причина в исключительном удобстве содержания и наблюдения за этими рыбами. Развитие данио от икринки (яйца) до малька (эмбриона) занимает всего три дня. С относительно большими и прозрачными эмбрионами легко производить манипуляции. Взрослые особи небольшие — помещаются в спичечный коробок — и неприхотливы к условиям содержания. У данио высокая репродуктивная способность [3] — при оптимальных условиях они способны выметать до трехсот икринок в неделю! Представьте, что вы работаете над кандидатской диссертацией, где в качестве модели нужно использовать позвоночных. И уже за первый год работы у вас есть шансы получить данные на сотнях и даже тысячах особей, тогда как ваш коллега из соседней лаборатории только получил нужную линию мышей и приступил к экспериментам!

Более широкое применение по сравнению с другими модельными видами рыб данио получили за счет возможности масштабирования экспериментов с ними путем высокопроизводительного анализа. Коммерческие компании предлагают готовые решения по размещению аквариумов с различными вариантами автоматизации [4], и это позволяет небольшой группе исследователей работать сразу с тысячами организмов (рис. 1).

Рисунок 1. Аквариумная система одной из лабораторий, работающих с данио рерио. В каждом аквариуме (танке) могут содержаться от десятков до сотен рыбок.

В 2003 году, вскоре после обнародования генома человека, был получен первый вариант генома данио рерио. Затем стартовал проект, в котором по очереди выключали («нокаутировали») все белок-кодирующие гены рыбы и определяли фенотипы полученных мутантов [5]. Например, данио в норме способны к регенерации желудочков сердца после их частичного удаления. Инактивирующие мутации в гене ttk, кодирующем фермент киназу Mps1, один из регуляторов клеточного цикла, приводят к потере такой сверхспособности [6]. А ведь сходный ген есть и у человека, и он тоже участвует в регенерации, правда, мы к ней способны гораздо меньше, чем рыбки.

Позднее исследователи обнаружили в геноме данио более 150 генов, кодирующих микроРНК [7], общих для всех известных позвоночных организмов. Без этих РНК развитие эмбриона идет неправильно, а иногда останавливается на одном из этапов [8]. Мутируя гены данио, а также иногда добавляя в геном рыбки участки чужой ДНК — трансгены, — исследователи смогли подробно исследовать развитие всех ее тканей и органов. Так, на протяжении тридцати лет данио рерио служит основной моделью в биологии развития. Недавно созданные методы анализа транскриптомов (всей совокупности РНК) или полного генома единичных клеток [9] немедленно применили к клеткам и тканям данио (рис. 2). И сейчас в распоряжении исследователей есть целые атласы развития этой рыбки, по которым можно отследить изменения профиля генной экспрессии от оплодотворенной яйцеклетки к тканям взрослого животного [10], [11].

Рисунок 2. С помощью методов секвенирования единичных клеток можно отследить, как происходит развитие тканей и органов

Теперь перейдем к любимой теме одного из авторов этого эссе, который работает врачом-генетиком. Как рыбка данио помогла понять природу генетических заболеваний человека и даже подступиться к их эффективному лечению?

Несмотря на многие миллионы лет, прошедшие с разделения наших видов, данио рерио и человек имеют 70% ортологичных генов [12]. В том числе, в геноме рыбки находятся гомологи 80% генов, ответственных у человека за наследственные моногенные заболевания [13]. Среди последних известно несколько сотен тяжелых неврологических болезней, одна из которых — спинальная мышечная атрофия (СМА) [14], [15]. Самая частая причина СМА — гомозиготная делеция 7-го и 8-го экзонов в гене Smn1, что приводит к разрушению альфа-мотонейронов спинного мозга и, в итоге, к смертельному заболеванию [16]. Исследователи смогли смоделировать этот синдром на линии данио с «нокаутом» гена Smn1 и заодно обнаружили другие гены, которые могут влиять на развитие заболевания. Одним из них оказался ген белка пластина-3 (PLS3). Усиление экспрессии этого гена и синтеза соответствующего белка в экспериментах снижало проявление нервно-мышечной симптоматики [17], [18]. Обнаружение таких генов-модификаторов может, с одной стороны, помочь глубже понять механизм развития наследственного синдрома, а с другой — предоставить новые потенциальные мишени для терапевтического воздействия.

Другой пример использования модели данио в области медицинской генетики — поиск терапии наследственного синдрома Драве. Это заболевание вызвано патогенными мутациями в гене SCN1A, кодирующем одну из субъединиц потенциал-зависимого натриевого канала нейронов головного мозга [19]. У детей с синдромом Драве обычно на фоне полного благополучия в возрасте 1–2 лет «дебютируют», как принято выражаться в медицине, приступы судорожной активности. После начала приступов происходит регресс психоречевого развития, нарушаются двигательные функции. Проблема в том, что судороги при синдроме Драве не снимаются обычными противоэпилептическими препаратами.

Поэтому исследователи решили выбрать потенциальное лекарство от этого синдрома путем перебора множества известных соединений. А в качестве модели выбрали линию-мутант данио рерио, имитирующую человеческий синдром Драве. Оказывается, у таких рыбок так же, как и у пациентов, возникает эпилептическая активность. Рыбьи приступы можно отслеживать с помощью автоматической системы, которая наблюдает за движениями мальков в каждой отдельной лунке планшета (рис. 3). В ходе работы исследовали более тысячи соединений, которые могли влиять на судорожные приступы. Из них только двадцать смогли продемонстрировать возвращение двигательного поведения до состояния контрольных, здоровых мальков. Всего четыре вещества из двадцати оказались при этом нетоксичными. Их воздействие исследовали более пристально, снимая рыбкам электроэнцефалограммы. В итоге, только диметадион — антагонист кальциевых каналов Т-типа — обеспечил больным малькам нормальную энцефалограмму [21]. В этом примере из тысячи веществ был выбран для дальнейшего исследования только один препарат. Представьте, что у человека известно больше тысячи генов, мутации в которых вызывают эпилептические приступы. Работы у нашей рыбки хватит еще надолго. Обратите внимание, что в этой работе, с учетом всех повторов, использовалось несколько тысяч особей данио! Насколько же проще было сделать такой эксперимент на рыбках, чем на известных модельных млекопитающих.

Рисунок 3. Технологическая платформа для исследований электрической активности головного мозга данио рерио

Данио — хорошая модель не только для редких наследственных, но и для распространенных заболеваний. Например, проблемы подбора лекарственной терапии существуют и для некоторых злокачественных опухолей. Живучие, адаптируемые к воздействию рыбки специальных линий позволяют пересадить им культуры опухолевых клеток от пациентов (рис. 4). Так буквально за несколько дней удается протестировать на реальных опухолях эффекты разных лекарственных препаратов [22]. Помимо рака, на рыбках исследуют такие связанные друг с другом состояния как инсулиннезависимый диабет и ожирение [23], [24].

Рисунок 4. Трансплантация клеток опухоли пациента для последующего лекарственного скрининга

Может быть, все физиологические и патологические процессы нашего организма нужно воссоздавать на этой прекрасной модели? Отметим, что у нее все же есть ограничения. Например, дыхательная система рыб, как читатели хорошо знают, принципиально отличается от нашей. Совсем иначе у них работает и выделительная система. Однако, для обширного поля экспериментов на данио остаются более общие для позвоночных процессы — тканевое развитие, нервная деятельность, воспаление, регенерация, неспецифический иммунитет и другие.

Данио — это первое позвоночное в нашем хит-параде, и насколько же хорошо это неприхотливое, быстро размножающееся существо моделирует болезни человека! Дальше — больше, нас ждут еще более близкие родственники. В следующей серии это, по сути, четвероногое — великая и ужасная шпорцевая лягушка Xenopus laevis.

  1. Laia Ribas, Francesc Piferrer. (2014). The zebrafish (Danio rerio) as a model organism, with emphasis on applications for finfish aquaculture research. Rev Aquacult. 6, 209-240;
  2. Walker C. and Streisinger G. (1983). Induction of mutations by gamma-rays in pregonial germ cells of zebrafish embryos. Genetics. 103, 125–136;
  3. Westerfield M. The zebrafish book. A guide for the laboratory use of zebrafish (Danio rerio) (4th Edition). Univ. of Oregon Press, Eugene, 2000;
  4. Filip Miscevic, Ori Rotstein, Xiao-Yan Wen. (2012). Advances in Zebrafish High Content and High Throughput Technologies. CCHTS. 15, 515-521;
  5. Kerstin Howe, Matthew D. Clark, Carlos F. Torroja, James Torrance, Camille Berthelot, et. al.. (2013). The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome. Nature. 496, 498-503;
  6. K. D. Poss. (2002). Heart Regeneration in Zebrafish. Science. 298, 2188-2190;
  7. Обо всех РНК на свете, больших и малых;
  8. E. Wienholds. (2005). MicroRNA Expression in Zebrafish Embryonic Development. Science. 309, 310-311;
  9. Секвенирование единичных клеток (версия — Metazoa);
  10. Daniel E. Wagner, Caleb Weinreb, Zach M. Collins, James A. Briggs, Sean G. Megason, Allon M. Klein. (2018). Single-cell mapping of gene expression landscapes and lineage in the zebrafish embryo. Science. 360, 981-987;
  11. Monica Tambalo, Richard Mitter, David G. Wilkinson. (2020). A single cell transcriptome atlas of the developing zebrafish hindbrain. Development. 147, dev184143;
  12. Ross N. W. Kettleborough, Elisabeth M. Busch-Nentwich, Steven A. Harvey, Christopher M. Dooley, Ewart de Bruijn, et. al.. (2013). A systematic genome-wide analysis of zebrafish protein-coding gene function. Nature. 496, 494-497;
  13. Máté Varga, Dorottya Ralbovszki, Eszter Balogh, Renáta Hamar, Magdolna Keszthelyi, Kálmán Tory. (2018). Zebrafish Models of Rare Hereditary Pediatric Diseases. Diseases. 6, 43;
  14. Надежда для СМАйликов;
  15. Самое дорогостоящее лекарство в мире;
  16. Suzie Lefebvre, Lydie Bürglen, Sophie Reboullet, Olivier Clermont, Philippe Burlet, et. al.. (1995). Identification and characterization of a spinal muscular atrophy-determining gene. Cell. 80, 155-165;
  17. L. T. Hao, M. Wolman, M. Granato, C. E. Beattie. (2012). Survival Motor Neuron Affects Plastin 3 Protein Levels Leading to Motor Defects. Journal of Neuroscience. 32, 5074-5084;
  18. Michelle L. McWhorter, Umrao R. Monani, Arthur H.M. Burghes, Christine E. Beattie. (2003). Knockdown of the survival motor neuron (Smn) protein in zebrafish causes defects in motor axon outgrowth and pathfinding. Journal of Cell Biology. 162, 919-932;
  19. Lieve Claes, Jurgen Del-Favero, Berten Ceulemans, Lieven Lagae, Christine Van Broeckhoven, Peter De Jonghe. (2001). De Novo Mutations in the Sodium-Channel Gene SCN1A Cause Severe Myoclonic Epilepsy of Infancy. The American Journal of Human Genetics. 68, 1327-1332;
  20. 12 методов в картинках: нейробиология;
  21. Matthew T. Dinday, Scott C. Baraban. (2015). Large-Scale Phenotype-Based Antiepileptic Drug Screening in a Zebrafish Model of Dravet Syndrome. eneuro. 2, ENEURO.0068-15.2015;
  22. Jianhong Lin, Weihong Zhang, Jian-Jun Zhao, Ariel H. Kwart, Chun Yang, et. al.. (2016). A clinically relevant in vivo zebrafish model of human multiple myeloma to study preclinical therapeutic efficacy. Blood. 128, 249-252;
  23. Takehiko Oka, Yuhei Nishimura, Liqing Zang, Minoru Hirano, Yasuhito Shimada, et. al.. (2010). Diet-induced obesity in zebrafish shares common pathophysiological pathways with mammalian obesity. BMC Physiology. 10, 21;
  24. Bo Chen, Yang-Min Zheng, Jing-Pu Zhang. (2018). Comparative Study of Different Diets-Induced NAFLD Models of Zebrafish. Front. Endocrinol.. 9;
  25. SoonGweon Hong, Philip Lee, Scott C. Baraban, Luke P. Lee. (2016). A Novel Long-term, Multi-Channel and Non-invasive Electrophysiology Platform for Zebrafish. Sci Rep. 6;
  26. Richard White, Kristin Rose, Leonard Zon. (2013). Zebrafish cancer: the state of the art and the path forward. Nat Rev Cancer. 13, 624-636.

Данио рерио рыбка. Описание, особенности, виды, содержание и уход

 

Описание и особенности

Эта рыбка была впервые обнаружена в водах юга Азии на полуострове Индостан в первой половине XIX столетия, и описана английским исследователем Гамильтоном. В дикой природе она встречается в реках и ручьях с медленным, быстрым, а чаще – с умеренным течением, а также на затопленный рисовых полях.

Данио рериорыбка совсем небольших размеров (около 5 см). Именно своей величиной, а также оригинальной расцветкой, игривым любопытным нравом, неприхотливостью и способностью мирно уживаться с себе подобными она привлекла внимание аквариумистов.

Ныне такие домашние водные жители чрезвычайно популярны и разводятся в аквариуме небольшими стаями. Именно такими группами они и существуют в природе, а потому не терпят и в домашних условиях одиночного содержания, слишком скучают.

Те из них, что продаются в зоомагазинах, родились в неволе, а потому прекрасно приспособлены к жизни и размножению в искусственной среде. Данио рерио по своему характеру весьма задорны и резвы. В любом доме они способны стать замечательным украшением, олицетворяя собой частичку живой природы.

Следует добавить, что таких рыбок ещё именуют дамскими чулочками, а иногда – зебрами за удивительный окрас. В их примечательном наряде основным цветовым фоном является чаще всего светло-жёлтый, по нему же вдоль всего веретенообразного, вытянутого по форме тела проходят синие полосы.

Подобный же узор распространяется по анальным плавникам и хвосту. В дикой природе подобная расцветка, являясь защитной, помогает рыбкам выжить, делая их неуязвимыми для врагов.

Виды

Рыбки данио, которых принято относить к семейству карповых, отличаются значительным видовым разнообразием. Данио рерио – самые распространённые и часто встречающиеся в аквариумном разведении. Особенно востребованными среди любителей природы являются рыбки с удлинёнными плавниками, так называемые вуалевые данио. Но и среди других разновидностей есть весьма популярные.

Наиболее интересные типы рыб данио будут представлены далее.

1. Флуоресцентные. В природе такие существа не встречаются, только в аквариуме, поскольку получены они путём генной модификации и имеют в наличии светящийся ген, который искусственно ввели в рыбий эмбрион.

Это цветные данио, распространяющие вокруг себя ультрафиолетовое и обычное белое сияние. Они имеют длину около 3 см и могут обладать фиолетовыми, синими, желто-оранжевыми, зелёными, ярко-красными и другими оттенками. Впервые такие рыбки получены путём интересного эксперимента доктора Гонга в 1999 году.

2. Леопардовый данио получил своё название за леопардовые пятна, покрывающие всё его тело. Данная разновидность в естественных условиях тоже не встречается, так как получена селекционным путём.

3. Маргаритатус – разновидность красочная, яркая. Тело таких рыб украшено золотистыми пятнами. Верх отмечен золотисто-жёлтой линией, низ ярко-оранжевый, плавники окаймлены бархатисто-чёрным.

4. Данио точечный. Его тело в верхней части имеет расцвету подобную обычным рерио, а нижняя отмечена тёмными точками. Низ брюшка белый или оранжевый. Величина таких существ около 4 см.

5. Вишнёвый. Обладает вишнёво-розовой расцветкой, украшенной тёмными полосками. Плавники могут выделяться жёлтым или красным оттенком, но могут быть и просто прозрачными.

6. Бенгальский. Длинной такие существ около 8 см. Основной фон их тела серебристый, отмеченный голубыми полосками и жёлтыми продольными областями. Спинной плавник таких рыб необычно длинный, что является одной их отличительных черт данной разновидности.

7. Жемчужный. Тело таких рыбок удлинённое, украшенное оранжевой полоской, спереди почти прозрачное, сзади голубоватое. Бесцветные плавники немного отсвечивают красноватым или зеленоватым. Сама рыбка под определённым углом светится перламутром. Длина около 5,5 см.

8. Розовый данио может похвастаться необыкновенным коралловым окрасом, отмеченным белыми продольными тонкими полосами. Это ещё одна выведенная искусственно разновидность. В естественных условиях такие рыбки есть, но выглядят далеко не так нарядно и красочно. Длина тела таких существ чуть более 4 см.

9. Эритромикрон – разновидность, отличающаяся небольшими размерами (около 3 см). Но расцветка этих существ крайне оригинальная и нарядная. На синевато-фиолетовом теле видны мелкие поперечные светлые полосы. А плавники, хвост и голова украшены рисунком из сочетаний розовых, жёлтых и других оттенков областей.

Самку данио рерио отличить от рыбок мужского пола можно по округлому (пузатому) брюшку. Такая же примета вполне годится и для других разновидностей данио. Правда, только для зрелых особей, потому что молодые рыбки обоих полов практически идентичны.

Взрослые женские особи не только более округлые, они заметно длиннее, а по окрасу немного блёклые. По характеру они осторожнее и медлительнее.  Самец данио рерио выглядит гораздо тоньше и стройнее, зато по поведению подвижнее, ведь отличается заметной резвостью.

 

Уход и содержание

Эти по природе стайные рыбки одиночества не жалуют. Более того отшельническое существование и даже жизнь в паре способны ввести таких крохотных существ в стрессовое состояние, повлечь за собой их нервозность и агрессивное поведение. В аквариуме их лучше всего держать группами по пять и более особей.

В подобном обществе рыбки данио всегда чувствуют себя спокойно и комфортно, они миролюбивы, весьма подвижны, игривы, забавны и любознательны. Из аквариумных существ других видов и форм им правильней всего подбирать тех, кто во многом схож с ними по темпераменту.

Впрочем, они замечательно уживаются, как со своими собратьями, так и с огромным количеством других разновидностей из живности домашнего аквариума.

Содержание данио рерио не влечёт значительных сложностей, а потому даже начинающие аквариумисты легко справляются с данной задачей. Но ряд тонкостей всё-таки существует, а потому при разведении следует учитывать некоторые особенности таких живых существ.

  1. В естественных условиях это жители верхних вод. А потому при их домашнем содержании лучше, чтобы на поверхности аквариума не скапливалось слишком много водорослей. Отсутствие густой верхней растительности даёт простор таким питомцам, чтобы они имели возможность порезвиться вволю.
  2. Сама ёмкость, где помещены такие подопечные может быть по объёму не слишком большой. Им вполне достаточно аквариума в 37 литров, но важно, чтобы он был в длину достаточно вытянутым, чтобы рыбки могли свободно перемещаться в верхних его слоях. Однако, именно в просторных водных жилищах владельцам по-настоящему интересно будет наблюдать за поведением таких забавных существ.
  3. К состоянию водной среды эти рыбки не требовательны, а потому их вполне можно размещать в аквариуме без подогрева. Но вода не должна быть застоявшейся, ежедневно меняться хотя бы на десятую часть объёма и иметь температуру не ниже +20°С. Важна система фильтрации, создающая достаточные водные токи, имитирующие течение. Здесь из фильтров прекрасно подойдёт силовой навесной внешний.
  4. Ёмкость, где содержатся данио, необходимо накрывать сверху. Ведь нередки случаи, когда они во время игры из воды выпрыгивают, что влечёт за собой весьма печальный, смертельный исход.
  5. Лучше всего для рыб постараться сымитировать в аквариуме привычную им природную среду. Для этого обычно используют тёмный песок, мелкий грунт, подходящие водные растения: яванский мох, роголистник, водную глицинию. Подобную флору лучше засаживать густо, но и не забывать отставлять достаточно простора для плавания аквариумных обитателей.

Питание

Аквариумные данио рерио к типу питания не слишком требовательны, по сути они всеядны. Таким рыбкам вполне подойдут корма как живые, так сухие и замороженные, лишь бы они оказались подходящими для их габаритов. Это могут быть личинки насекомых, мелкие ракообразные, черви.

Добыча в виде мотыля и трубочника даёт возможность таким существам порезвиться в погоне за ней, а потому живые корма рекомендуются обычно специалистами более других. Рацион из сухого питания имеет при использовании тонкость, подобному угощению прежде желательно основательно помокнуть, плавая определённое время на поверхности.

Потчевать таких питомцев следует ежедневно. При этом весь объём можно скармливать в один раз или давать в несколько приёмов, но незначительными порциями, равномерно распределяя кормёжки в течение суток.

Необходимо обязательно следить, чтобы маленькие водоплавающие питомцы съедали всё в срок, то есть по истечении трёх минут после начала обеда или ранее. При одноразовой кормёжке период поглощения еды может растягиваться до пяти минут. По скорости съедания корма легко можно определить норму, которую разумно выделять таким подопечным.

Эти маленькие аквариумные существа – большие обжоры и лакомки, а потому очень важно следить за тем, чтобы их не перекормить. Также следует помнить, что от правильного кормления зависит то, как выглядит данио рерио.

Размножение и продолжительность жизни

Зрелыми для разведения такие рыбки становятся к восьми месяцам. У самок к этому периоду округляется брюшко, а мужские особи приобретают насыщенный окрас. Именно по этим приметам владельцы обычно понимают, что их подопечные готовы к воспроизведению себе подобных.

Получить потомство в аквариуме от таких рыб достаточно просто. Данио легко заставить нереститься, а мальков вырастить и выкормить тоже нетрудно. Прежде всего необходимо заприметить подходящую пару (или группу, потому что самцов может быть несколько).

Лучше отобрать особей покрупней и поместить их отдельно от других в подходящую ёмкость, заранее обеспечив в ней нужные условия: свежую отстоявшуюся воду, температуру около +25°С, там же следует разместить камушки, мох, водные растения.

Далее размножение данио рерио происходит самым естественным путём: отложенную рыбкой-мамой икру оплодотворяют её партнёры, давая возможность развиваться новым живым организмам.

По окончании нереста взрослых рыбок помещают в общий аквариум, в противном случае они вполне способны скушать отложенные икринки. Если же они остаются в сохранности, из этих крупинок жизни мальки появятся по истечении трёх суток.

Малышей первые один или два дня обычно потчуют живой пылью – мельчайшими микроорганизмами, которые опытные аквариумисты приспособились выращивать сами. А потом можно переходить на сухие корма, только очень мелко перетёртые, или яичный желток.

Очень важно при разведении мальков вовремя пересаживать от остальных наиболее крупных. Если этого не сделать, то скорее всего переростки начнут питаться своими братьями и сёстрами.

Данио особенно долго не живут. Срок, отмеренный природой для таких рыб, составляет обычно не более двух или трёх лет. В отдельных случаях такие маленькие водоплавающие питомцы доживают до пяти лет.

Возможные болезни и способы лечения

Аквариумные рыбки, как и все живые организмы, к сожалению, иногда болеют. Не избегает такой участи и данио рерио. Уход за такими питомцами несложный, но он предполагает, кроме всего прочего, и защиту маленьких существ от различных недугов, о которых владельцам следует знать.

Прежде всего профилактика заболеваний предусматривает периодический внешний осмотр рыбок, целью которого является нахождение возможных повреждений кожных покровов, ставших результатом болезненного состояния подопечных или механических травм.

Но здесь следует помнить, что болезненная бледность стразу после приобретения и смены места жительства далеко не всегда необходимо считать тревожным признаком. Указанный симптом может являться свидетельством стресса, полученного крошечным созданием от изменения внешних условий.

Здесь разумнее всего для аквариумиста будет поселить нового подопечного подальше от прочих рыб в другую ёмкость с целью наблюдения за его поведением. И лишь только после того, как придёт уверенность в его удовлетворительном состоянии, рыбку можно разместить в общем аквариуме.

Среди основных заболеваний данио следует отметить перечисленные ниже.

  1. Пучеглазие. Основными симптомами данного недуга являются: увеличение брюшка, выпученные глаза. Причиной здесь обычно бывает неудовлетворительное качество водной среды. Замена её на более соответствующую и станет способом лечения.
  2. Триходиноз. Здесь причина кроется в недостаточной чистоте аквариума, так как это заболевание инфекционное. Признаки: смена цветовых покровов рыб (они становятся бледными с оттенком грязноты), а также необычное желание подопечного тереться (чесаться) об аквариумные стенки. Для избавления от напасти необходимо поднять водную температуру до +30°С и делать ванны для питомцев с поваренной солью. Примерно такие же методы лечения подходят и в случае возникновения на коже питомцев болезненных наростов.
  3. Туберкулёз опасен не только для человека, но также для рыб, и является обычно следствием заражения, которое происходит через водоросли и грунт. Среди симптомов: плохой аппетит, вялость, выпадение чешуи. Здесь в качестве лекарственного средства, которое помогает исключительно на начальных стадиях, обычно применяется канимицин, который подмешивается к корму.
  4. Алкалоз возникает, когда нарушается нормальная кислотность воды. Симптомами являются: зуд кожных покровов, заметное беспокойство. Для восстановления кислотности используют рН-буфер.

А вообще данио считаются на редкость здоровыми рыбками. И при соблюдении всех мер предосторожности в содержании, они способны постоянно радовать своих хозяев игривым нравом и замечательным внешним видом.

 

Размножение рыбок данио в домашних условиях

Сегодня мы будем выяснять, живородящие или нет. Ведь это один из самых популярных и часто встречаемых видов аквариумных рыбок. Безусловно, все видели хотя бы раз, как внутри резервуара синхронно снуёт из угла в угол небольшой косячок маленьких рыбок в «полосатых купальниках».

Это и есть рыбки данио – самый уживчивый и добродушный жилец вашего аквариума. О том, как происходит размножение данио, мы и поговорим.

Немного о данио

Этот вид относится к семейству карповых рыб. Родиной рыбок данио являются реки и водоёмы юго-восточной Азии. Они встречаются в таких странах, как Индия, Таиланд, Бангладеш, а также о. Суматра.

Что можно сказать о даничках.

Это совсем небольшая, длиной около 7 см. рыбка. У неё слегка удлинённое тельце, приплюснутое по бокам. Цветовая палитра окраса этих рыбок колеблется от белого до ярко-красного цветов. А наиболее узнаваемой чертой внешнего вида «даничек», безусловно, можно назвать несколько горизонтальных тёмных полосок, идущих вдоль тела.

Для рыбок этого вида характерен половой диморфизм. Он не столь ярко выражен, как, скажем, у или меченосцев. Но всё же отличить самца от самки не представляется трудной задачей. Самка имеет несколько более выпуклое брюшко, а также полоски на её теле выглядят более чёткими, нежели у самцов.

Данио предпочитают жить в небольших группках численностью в 8-10 особей. Эту особенность образа их жизни следует учитывать при содержании данио в условиях аквариума. Рыбка будет несчастлива, если вы поселите её в одиночестве. Она будет постоянно искать укрытия, поскольку вне косяка данио чувствуют себя крайне неуютно.

В целом говоря, стоит подчеркнуть очень хороший уровень выживаемости рыбок этого вида в условиях домашнего содержания. очень неприхотливы.

Они неплохо переносят температурные колебания внутри резервуара, практически всеядны, а также обладают весьма добрым и мирным нравом, что очень важно при содержании в общем аквариуме. Таким образом, уход за рыбками этого вида не представляет собой большого труда даже для начинающего аквариумиста.

Практически то же самое можно сказать и об относительной простоте в отношении разведения данио с целью получения потомства. Размножаются эти рыбки в домашних условиях также просто, как и содержаться. И на этом важном и интересном вопросе их воспроизводства мы сегодня и сконцентрируемся.

Особенности нереста у данио

Сразу следует сказать, что данио относятся к икромечущим рыбам. В отличие от живородящих рыб, вроде гуппи или меченосцев, самки этого вида не производят на свет крошечных мальков сразу. Они откладывают огромное количество маленьких клейких икринок, из которых чуть позже появляются на свет будущие данио рыбки. Но обо всём по порядку.

Половозрелыми эти рыбки становятся довольно быстро. Ведь разведение данио, с использованием едва достигших трёхмесячного возраста особей, вполне нормальная практика.

Подготовка к такому ответственному процессу, как нерест данио, начинается со стимуляции его возникновения.

Стоит напомнить, что в дикой природе на начало нереста у данио оказывает влияние повышение температуры воды, вызванное приходом сезонов дождей, что весьма характерно для юго-восточных регионов Азии. Размножается этот вид только в условиях максимального комфорта, это заложено природой. Ведь на уровне безусловного инстинкта даже «глупая» рыба понимает, что именно при тех условиях, которые она сама считает наилучшими для себя, её потомство будет иметь наилучшие шансы на выживание.

Таким образом, с целью напомнить рыбкам о том, что наступает пора размножаться, следует также повысить на несколько градусов температуру внутри резервуара. Это надо делать постепенно, также не забывая вовремя осуществлять замену воды.

Вообще этот период должен стать своего рода настоящим «медовым месяцем» для нерестящихся рыбок. К идеальным показателям характеристик воды следует добавить отборное кормление, лучше всего живым кормом, таким как дафния и циклоп. Данио должны себя чувствовать настолько хорошо и уверенно, насколько это вообще возможно.

При соблюдении всего вышесказанного, можно проводить этот процесс и в общем аквариуме. Однако отложенная икра, и даже уже вылупившиеся из неё мальки данио могут стать хорошей закуской как для других аквариумных рыб, так и для самих родителей. Поэтому, дабы не потерять икру и мальков, следует все же соорудить временную обитель для молодняка.

В качестве нерестилища может выступать даже обыкновенная трехлитровая банка, с заранее отстоянной в течение суток водой. Но, всё же, выращивать мальков в банке – весьма аскетичный вариант. По возможности, лучше будет использовать отдельный резервуар объёмом в 10 литров.

На дно следует положить трёхсантиметровый слой нетвёрдого грунта, а ещё лучше будет в качестве настила использовать специальную сеточку, отделяющую сантиметровую донную зону от остальной территории аквариума. Такой нерестовик можно считать идеальным, поскольку сетка защитит упавшие на дно икринки от посягательств со стороны родителей.

Что происходит в нерестовике?

Итак, подготовив место для проведения медового месяца для нерестящихся рыбок, следует выбрать, собственно, готовых к нересту особей.

Для этого хватит одной самки и двух-трёх активных самцов. Беременных самок выдаёт набухшее брюшко, ближе к анальному плавнику. Такая картина означает, что время откладывать икру наступило.

В таком случае, следует пересадить самку и самцов в нерестилище. Это лучше сделать вечером, поскольку обычно икрометание происходит рано утром. Самцы начинают преследовать самку, ударяясь об нижнюю часть её брюшка.

Это действие стимулирует икрометание. Оплодотворённая самцами икра опускается на дно, где проскальзывает сквозь установленную сетку и будет в безопасности до момента появления из неё молодняка. Сам процесс длится примерно около часа, и может проходить в несколько подходов. Ведь икры много, и она выходит отнюдь не сразу, для полного освобождения самке нужно время.

Проблем с икрой обычно не возникает. Икра данио ни чем не отличается от любой другой. Это крохотные клейкие кругляши, некоторым из которых суждено дать жизнь новым особям этого вида.

В принципе, для уверенности в сохранности икринок можно заранее продезинфицировать воду двухпроцентным раствором йода, хватит 2-х капель на 10л. воды. Для этой же цели можно использовать также пенициллин, только его предварительно следует развести в стакане с водой комнатной температуры. Эти меры предосторожности могут помочь избежать поражения икринок заболеваниям.

Обычно спустя 3-4 дня из икринок появляются маленькие личинки. Пока они не выросли и не стали мальками, их следует кормить инфузорией. Позже, когда мальки вырастут, им можно давать тех же дафний. Обычно спустя месяц они приобретают окраску, характерную для взрослой особи, и могут быть выпущены в общий аквариум.

После окончания икрометания, отнерестившихся рыб можно вернуть в общий аквариум, где ещё в течение некоторого времени их следует кормить живым кормом и содержать при умеренной температуре.

Если нерест не удаётся

Случается и так, что, несмотря на все наши старания и соблюдение всех правил, о которых говорилось выше, наши питомцы так или иначе отказываются порадовать нас произведением на свет долгожданно потомства.

Причин сему может быть несколько. Главная из них – некачественные родители. Также рыбки просто могут по непонятным причинам избегать контакта. Часто бывает, что самка забивается в гущу водорослей, а самцы при этом не проявляют к ней особого интереса в данный конкретный период времени.

В последнем случает не стоит отчаиваться. Это всё-таки не механический процесс и не компьютерная программа, где пользователь задает алгоритм действий и вправе ждать непременного выполнения свой команды. Рыбки могут просто капризничать сегодня.

Следует запастись терпением, и продолжить усиленное кормление и содержание выбранных для нереста особей в идеальных условиях, при этом наблюдая за их поведением. Вполне вероятно, рыбки всё же откликнутся на зов природы и через пару дней выполнят свой естественный долг внутривидового воспроизводства.

Заключение

Итак, как мы смогли убедиться, разводить данио в аквариумных условиях немногим сложнее, нежели ухаживать за ними день ото дня.

Мы также разобрались в том, как разводить этих рыбок правильно и сколько времени требуется молодняку для достижения статуса взрослой рыбы.

Зачем использовать рыбок данио для изучения болезней человека?

Элизабет Берк

вторник, 9 августа 2016 г.

Ученые используют различные лабораторные методы для изучения генетической причины болезней человека. В исследованиях часто используются образцы клеток или тканей пациентов, но чтобы определить, может ли мутация в конкретном гене вызвать симптомы у пациента, нам часто нужны экспериментальные модели животных.

В то время как мыши и крысы были обычным выбором для моделирования заболеваний человека в прошлом, использование рыбок данио быстро набирает популярность.Вас это удивляет? Позволь мне объяснить.

Что такое рыбки данио?

Рыбки данио — тропические пресноводные рыбы семейства гольянов. В дикой природе они встречаются в реках и прудах Индии, однако теперь их часто можно купить в зоомагазинах. Название «зебрафиш» происходит от горизонтальных синих полос на каждой стороне их тела.

Рыбки данио, названные так из-за своих полос, предпочитают жить большими группами, называемыми косяками.

Как можно смоделировать человеческое заболевание у рыб?

Хотя люди могут казаться чрезвычайно отличными от рыбок данио, на самом деле мы гораздо больше похожи на них, чем вы думаете.На самом деле, 70% человеческих генов обнаружены у рыбок данио.

Кроме того, у рыбок данио есть два глаза, рот, головной мозг, спинной мозг, кишечник, поджелудочная железа, печень, желчные протоки, почки, пищевод, сердце, ухо, нос, мышцы, кровь, кости, хрящи и зубы. Многие гены и критические пути, необходимые для развития этих признаков, в высокой степени консервативны между людьми и рыбками данио. Таким образом, у рыбок данио теоретически можно смоделировать любой тип заболевания, вызывающий изменения в этих частях тела у человека.

Зачем использовать рыбок данио, если можно использовать мышей?

Хотя мыши эволюционно больше похожи на людей, поскольку являются млекопитающими, у рыбок данио есть несколько преимуществ перед их пушистыми конкурентами.

Одним из важных преимуществ рыбок данио является то, что взрослые особи маленькие и предпочитают жить большими группами или «косяками». В результате они требуют гораздо меньше места и дешевле в обслуживании, чем мыши.

Центр рыб данио NIH содержит сотни тысяч рыбок данио в ультрасовременном помещении.

Еще одним преимуществом является то, что взрослые рыбки данио легко размножаются (примерно каждые 10 дней) и могут производить от 50 до 300 икринок за раз. Это сильно отличается от мышей, поскольку они обычно производят пометы от одного до 10 детенышей и могут родить только примерно три помета за свою жизнь. Научные эксперименты обычно повторяются несколько раз, чтобы доказать точность результатов, поэтому полезно иметь животное, которое может производить большое количество потомства снова и снова.

Эмбрионы

рыбок данио также закладываются и оплодотворяются извне, что позволяет легко манипулировать ими различными способами. При необходимости можно провести экстракорпоральное оплодотворение . В оплодотворенные яйца на стадии одной клетки можно легко ввести ДНК или РНК, чтобы навсегда изменить их генетический состав, чтобы получить трансгенные или нокаутированные линии рыбок данио. Работать с мышами таким способом намного сложнее. Эмбрионы мыши развиваются внутри матери, и чтобы получить к ним доступ и манипулировать ими, мать должна быть принесена в жертву.Чтобы сохранить жизнь эмбрионов после их оплодотворения или инъекции, их также необходимо будет пересадить другой самке мыши.

Личинка рыбки данио, стадия развития от трех до тридцати дней после оплодотворения, вырастает в длину примерно от 3,5 до 8 миллиметров.

Кроме того, эмбрионы рыбок данио прозрачны, что позволяет ученым наблюдать под микроскопом, как оплодотворенная икра превращается в полностью сформированного детеныша рыбки. Их прозрачность также позволяет визуализировать флуоресцентно меченные ткани в трансгенных эмбрионах рыбок данио.Эмбрионы мыши непрозрачны и развиваются внутри матери, поэтому наблюдение за развитием живых эмбрионов, как у рыбок данио, невозможно.

Однако существует ограничение на то, какие типы болезней можно изучать у рыбок данио. Болезни человека, вызванные генами, которых нет у рыбок данио, требуют другой животной модели. Кроме того, рыбки данио не являются полезными моделями заболеваний человека, которые в основном возникают в тканях или частях тела, которых у рыбок данио нет (например, в предстательной железе, молочных железах, легких).

Как именно вы используете рыбок данио для изучения болезней человека?

Часто ДНК пациента секвенируют, чтобы найти мутацию в гене, которая потенциально может вызвать симптомы заболевания. Чтобы определить, может ли потеря функции этого гена вызвать симптомы, наблюдаемые у пациента, тот же ген мутирует или «отключается» у рыбок данио, а затем рыб обследуют на наличие сходных симптомов. Хотя это гораздо сложнее сделать, точная мутация, которая есть у пациента, также может быть введена в рыбок данио — это называется «нок-ин».

Если один или несколько симптомов пациента наблюдаются в модели нокаута или нокаута рыбок данио, рыбок данио можно использовать для дальнейших исследований, чтобы помочь определить, почему мутация в этом гене вызывает заболевание. Например, структуру мышечных волокон можно исследовать под микроскопом на наличие аномалий, если у пациента есть мышечное заболевание. Или, если симптомы заболевания у пациента начались во время развития внутриутробно , нокаутированные или нокаутированные эмбрионы рыбок данио можно исследовать на предмет изменений экспрессии генов (по сравнению с эмбрионами без мутации), которые могут привести к аномальному развитию.Для пациента с неврологическим заболеванием нейроны нокаутных эмбрионов можно пометить флуоресцентно, чтобы увидеть, формируются ли они неправильно.

В дополнение к использованию моделей болезней рыбок данио для характеристики болезней человека, исследователи также могут определять и тестировать новые лекарства для лечения моделируемых заболеваний. Способность рыбок данио генерировать много эмбрионов каждый раз, когда они размножаются, делает их особенно полезными для высокопроизводительного скрининга наркотиков.

Какие примеры болезней человека были успешно смоделированы у рыбок данио?

Было показано, что генерация нокаута гена дистрофина у рыбок данио очень напоминает тяжесть и прогрессирование мышечной дистрофии Дюшенна у человека.Было обнаружено, что пациенты с мышечной дистрофией Дюшенна являются носителями мутаций дистрофина и демонстрируют детскую мышечную слабость, которая постепенно ухудшается. Как у людей, так и у рыбок данио потеря дистрофина постепенно приводит к некрозу мышечных волокон, которые замещаются воспалительными клетками, фиброзом и мышечными волокнами аномального размера.

На этом рисунке показаны визуальные различия в мышцах личинок данио дикого типа (A, B, C) и дистрофических личинок (A’, B’, C’).Источник: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3484855/

Меланома человека также была успешно смоделирована у рыбок данио. Наиболее часто идентифицируемая мутация в меланомах человека — изменение одной аминокислоты в гене BRAF — была создана у рыбок данио, чтобы создать модель нокаута. Поскольку рак вызывается комбинацией нескольких генетических изменений, эта линия рыбок данио была использована для скрининга других потенциальных мутаций, вызывающих рак. Когда другая часто наблюдаемая мутация меланомы гена SETDB1 была добавлена ​​к рыбке данио BRAF , нокаут-ин, меланома быстро развилась.Эти результаты помогли установить, что SETDB1 является важным геном роста меланомы.

Изображения нокаутированной рыбки данио, которая экспрессирует только мутацию BRAF (вверху), и той, которой также вводили вектор на основе транспозонов (miniCoopR), содержащий мутантную форму гена SETDB1 (внизу). Добавление мутации SETB1 привело к меланоме (указано стрелкой). Источник: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3348545/

.

Эти примеры того, как люди и рыбки данио могут проявлять одну и ту же болезнь, несмотря на то, насколько мы разные, позволяют легко понять, почему рыбки данио становятся общепринятой моделью животных.Здесь, в рамках Программы недиагностированных заболеваний NIH, мы проводим исследования с использованием рыбок данио в качестве одного из нескольких подходов к изучению потенциального участия измененных генов в чрезвычайно редких заболеваниях наших пациентов. В то время как мыши были преобладающим связующим звеном между скамьей и кроватью в прошлом, недавние исследования продемонстрировали потенциал рыбок данио в качестве послушной альтернативы мышам. Время принятия рыбок данио в качестве нового модельного организма не могло быть лучше, поскольку исследования на мышах часто не переносятся на людей.Хотя ни одно животное не может идеально смоделировать человеческую болезнь, я считаю, что у этих маленьких полосатых пловцов есть большой потенциал для продвижения медицинских исследований в будущем.

Чтобы узнать больше о том, как рыбки данио вносят вклад в биомедицинскую науку и здоровье человека, посетите веб-сайты Trans-NIH Zebrafish Initiative и NICHD Zebrafish Core.

Рыбки данио: новая модельная система в реальном времени для изучения болезни Альцгеймера и разработки нейроспецифических лекарств

  • Newman, M., Эбрахими, Э. и Ларделли, М. Использование модели рыбок данио для исследования болезни Альцгеймера. Перед. Жене. 5 , 189 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Детрих, Х. В. 3-й, Вестерфилд, М. и Зон, Л. И. Обзор системы данио. Методы Cell Biol. 59 , 3–10 (1999).

    КАС пабмед Google ученый

  • Купер, М.С., Д’Амико, Л. А. и Генри, К. А. Анализ морфогенетического поведения клеток у окрашенных прижизненно эмбрионов рыбок данио. Методы Мол. биол. 122 , 185–204 (1999).

    КАС пабмед Google ученый

  • Купер, М.С., Д’Амико, Л.А. и Генри, К.А. Конфокальный микроскопический анализ морфогенетических движений. Методы Cell Biol. 59 , 179–204 (1999).

    КАС пабмед Google ученый

  • Киммел, К.B. Генетика и раннее развитие рыбок данио. Тенденции Жене. 5 , 283–288 (1989).

    КАС пабмед Google ученый

  • Kimmel, CB & Warga, RM. Клеточная линия и потенциал развития клеток у эмбрионов рыбок данио. Тенденции Жене. 4 , 68–74 (1988).

    КАС пабмед Google ученый

  • Солница-Крезель, Л., Стемпл, Д. Л. и Драйвер, В. Прозрачные вещи: судьбы клеток и движения клеток во время раннего эмбриогенеза рыбок данио. Bioessays 17 , 931–939 (1995).

    КАС пабмед Google ученый

  • Шпицберген, Дж. М. и Кент, М. Л. Современное состояние модели рыбок данио для исследований в области токсикологии и токсикологической патологии — преимущества и текущие ограничения. Токсикол. Патол. 31 , 62–87 (2003).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Rosemberg, D.B. et al. Поведенческие эффекты предварительной обработки таурином у рыбок данио, остро подвергшихся воздействию этанола. Нейрофармакология 63 , 613–623 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Tran, S. & Gerlai, R. Тридцатисекундная сетевая стрессорная задача у взрослых рыбок данио. Биография. Протокол . 5 , e1413 (2015).

  • Hwang, W.Y. et al. Эффективное редактирование генома у рыбок данио с использованием системы CRISPR-Cas. Нац. Биотехнолог. 31 , 227–229 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Хисано, Ю., Ота, С. и Кавахара, А. Редактирование генома с использованием искусственных специфических нуклеаз у рыбок данио. Дев. Разница в росте. 56 , 26–33 (2014).

    КАС пабмед Google ученый

  • Schmid, B. & Haass, C. Редактирование генома открывает новые возможности для рыбок данио в качестве модели нейродегенерации. Дж. Нейрохим. 127 , 461–470 (2013).

    КАС пабмед Google ученый

  • Эбрахими Э., Фрузангохар М., Мусави Ник С. Х. и Ньюман М.Генный онтологический анализ данных omics рыбок данио с использованием сравнительной онтологии генов веб-инструмента. Рыбки данио 14 , 492–494 (2017).

    КАС пабмед Google ученый

  • Каммингс, Дж. Л. Болезнь Альцгеймера. Н. англ. Дж. Мед. 351 , 56–67 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Стефаначчи, Р.G. Затраты на болезнь Альцгеймера и ценность эффективных методов лечения. утра. Дж. Манаг. Care 17 (Приложение 13), S356–S362 (2011 г.).

    ПабМед Google ученый

  • Серрано-Позо, А., Фрош, М.П., ​​Маслия, Э. и Хайман, Б.Т. Нейропатологические изменения при болезни Альцгеймера. Гавань Колд Спринг. Перспектива. Мед. 1 , а006189 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Вуазен, Т.и Веллас, Б. Диагностика и лечение пациентов с тяжелой болезнью Альцгеймера. Лекарства от старения 26 , 135–144 (2009).

    ПабМед Google ученый

  • Бленноу К., де Леон М. Дж. и Зеттерберг Х. Болезнь Альцгеймера. Ланцет 368 , 387–403 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Регёр, Л., Jensen, G.B., Pakkenberg, H., Evans, S.M. & Pakkenberg, B. Нет глобальной потери неокортикальных нервных клеток в головном мозге у пациентов со старческим слабоумием по типу болезни Альцгеймера. Нейробиол. Старение 15 , 347–352 (1994).

    КАС пабмед Google ученый

  • Вест, М.Дж., Коулман, П.Д., Флад, Д.Г. и Тронкосо, Дж.К. Различия в характере потери нейронов гиппокампа при нормальном старении и болезни Альцгеймера. Ланцет 344 , 769–772 (1994).

    КАС пабмед Google ученый

  • Леви Ногейра, М. и др. Механический стресс, связанный с атрофией головного мозга при болезни Альцгеймера. Болезнь Альцгеймера. 12 , 11–20 (2016).

    ПабМед Google ученый

  • Доршевска Й., Прендецки М., Очковска А., Дезор М. и Козубски В.Молекулярные основы семейной и спорадической болезни Альцгеймера. Курс. Альцгеймер Res. 13 , 952–963 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Selkoe, D.J. & Podlisny, M.B. Расшифровка генетической основы болезни Альцгеймера. год. Преподобный Геномикс Хам. Жене. 3 , 67–99 (2002).

    КАС пабмед Google ученый

  • Берд, Т.D. in GeneRevi ews ® (под ред. MP Adam et al.) (Вашингтонский университет, Сиэтл, 1993–2018 гг.).

  • Ким Дж., Басак Дж. М. и Хольцман Д. М. Роль аполипопротеина Е при болезни Альцгеймера. Нейрон 63 , 287–303 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кордер, Э. Х. и др. Доза гена аллеля 4 типа аполипопротеина Е и риск развития болезни Альцгеймера в семьях с поздним началом. Наука 261 , 921–923 (1993).

    КАС пабмед Google ученый

  • Strittmatter, W. J. et al. Аполипопротеин Е: высокоавидное связывание с бета-амилоидом и повышенная частота аллеля типа 4 при семейной болезни Альцгеймера с поздним началом. Проц. Натл акад. наук США 90 , 1977–1981 (1993).

    КАС пабмед Google ученый

  • Харди, Дж.А. и Хиггинс, Г. А. Болезнь Альцгеймера: гипотеза амилоидного каскада. Наука 256 , 184–185 (1992).

    КАС пабмед Google ученый

  • Verdile, G. et al. Роль бета-амилоида в болезни Альцгеймера: все-таки причина всего или единственный, кого поймали? Фармакол. Рез. 50 , 397–409 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Карран, Э.и Де Струпер, Б. Гипотеза амилоидного каскада: готовы ли мы к успеху или неудаче. Дж. Нейрохим. 139 , 237–252 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Hardy, J. & Selkoe, D. J. Амилоидная гипотеза болезни Альцгеймера: прогресс и проблемы на пути к терапии. Наука 297 , 353–356 (2002).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Фрэнсис П.Т., Палмер А.М., Снейп М. и Уилкок Г.К. Холинергическая гипотеза болезни Альцгеймера: обзор прогресса. Дж. Нейрол. Нейрохирург. Психиатрия 66 , 137–147 (1999).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Maccioni, R. B., Farias, G., Morales, I. & Navarrete, L. Гипотеза обновленного тау при болезни Альцгеймера. Арх. Мед. рез. 41 , 226–231 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Берридж, М. Дж. Гипотеза кальция при болезни Альцгеймера. Плав. Арх.: Евро. Дж. Физиол. 459 , 441–449 (2010).

    КАС Google ученый

  • Гипотеза кальция Ассоциации Альцгеймера. W. Гипотеза кальция о болезни Альцгеймера и старении мозга: основа для интеграции новых данных во всестороннюю теорию патогенеза. Болезнь Альцгеймера. 13 , 178–182 e117 (2017).

    Google ученый

  • Свердлоу, Р. Х., Бернс, Дж. М. и Хан, С. М. Гипотеза митохондриального каскада болезни Альцгеймера. J. Alzheimers Dis. 20 (Приложение 2), S265–S279 (2010).

    ПабМед Google ученый

  • Вуллиманн, М., Рупп, Б. и Райхерт, Х. Введение: нейроанатомия для нейрогенетической модельной системы.В: Нейроанатомия мозга рыбок данио . Ч. 1, 1–5 (Биркхойзер Базель, Швейцария, 1996).

  • Мюллер Т. и Вуллиманн М. Эволюционная интерпретация анатомии костной кости переднего мозга. Поведение мозга. Эвол . 74 , 30–42 (2009).

  • Вуллиманн, М., Б. Рупп, Д. и доктор Х. Райхерт, П. Мозг данио Данио рерио : обзор. В: Нейроанатомия мозга рыбок данио. Ч. 3, 7–17 (Биркхойзер Базель, Швейцария, 1996).

  • Ринк, Э. и Вуллиманн, М. Соединения вентрального конечного мозга (субпаллиума) у рыбок данио (Danio rerio). Мозг Res. 1011 , 206–20 (2004).

  • Mueller, T., Vernier, P. & Wullimann, M. Центральная нервная холинергическая система взрослого животного с нейрогенной моделью, рыбки данио Danio rerio. Мозг Res. 1011 , 156–169 (2004).

  • Braford, M. R. Jr. Сравнительные аспекты организации переднего мозга лучеперых рыб: пробные камни или нет? Поведение мозга.Эвол. 46 , 259–274 (1995).

    ПабМед Google ученый

  • Мюллер, Т., Донг, З., Бербероглу, М.А. и Го, С. Спинной мундштук у рыбок данио, Danio rerio (Cyprinidae, Teleostei). Мозг Res. 1381 , 95–105 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Northcutt, R.G. Соединения латерального и медиального отделов конечного мозга золотых рыбок. Дж. Комп. Нейрол. 494 , 903–943 (2006).

    ПабМед Google ученый

  • Портавелла, М., Варгас, Дж. П., Торрес, Б. и Салас, К. Влияние поражений телэнцефалической оболочки на пространственное, временное и эмоциональное обучение золотых рыбок. Мозг Res. Бык. 57 , 397–399 (2002).

    КАС пабмед Google ученый

  • Рико, Э.П. и др. Нейротрансмиттерные системы рыбок данио как потенциальные фармакологические и токсикологические мишени. Нейротоксикол. Тератол. 33 , 608–617 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Park, E., Lee, Y., Kim, Y. & Lee, CJ. Холинергическая модуляция нервной активности в конечном мозге рыбок данио. Неврологи. лат. 439 , 79–83 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Панула, П.и другие. Модулирующие нейротрансмиттерные системы и поведение: к моделям нейродегенеративных заболеваний у рыбок данио. Рыбки данио 3 , 235–247 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Чен, Ю. К., Приядаршини, М. и Панула, П. Комплементарная экспрессия двух транскриптов тирозингидроксилазы в процессе развития у рыбок данио. Гистохим. Клеточная биол. 132 , 375–381 (2009).

    КАС пабмед Google ученый

  • Аниччик О., Саллинен В., Пейтсаро Н. и Панула П. Различная структура и активность моноаминоксидазы в мозге рыбок данио (Danio rerio). Дж. Комп. Нейрол. 498 , 593–610 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Каваи Х., Арата Н. и Накаясу Х. Трехмерное распределение астроцитов в спинном мозге рыбок данио. Glia 36 , 406–413 (2001).

    КАС пабмед Google ученый

  • Peri, F. & Nusslein-Volhard, C. Живая визуализация деградации нейронов микроглией показывает роль v0-ATPase a1 в слиянии фагосом in vivo. Cell 133 , 916–927 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Йошида, М. и Маклин, В.B. Развитие олигодендроцитов и миелинизация у GFP-трансгенных рыбок данио. J. Neurosci. Рез. 81 , 1–8 (2005).

    КАС пабмед Google ученый

  • Коулен П., Яновиц Т., Джонстон Л. Д. и Эрлих Б. Э. Сохранение паттернов локализации IP(3) рецептора типа 1 в клетках Пуркинье мозжечка у разных видов позвоночных. J. Neurosci. Рез. 61 , 493–499 (2000).

    КАС пабмед Google ученый

  • Авила Р.Л., Тевлин Б.Р., Лиз Дж.П.Б., Иноуе Х. и Киршнер Д.А. Структура и состав миелина у рыбок данио. Нейрохим. рез. 32 , 197–209 (2007).

    КАС пабмед Google ученый

  • Вестерфилд М., МакМюррей Дж. В. и Эйзен Дж. С. Идентифицировали мотонейроны и их иннервацию осевых мышц у рыбок данио. J. Neurosci. 6 , 2267–2277 (1986).

    КАС пабмед Google ученый

  • Стил, А. и Драпо, П. Паттерны мечения нейронов в спинном мозге взрослых трансгенных рыбок данио. Дев. Нейробиол. 76 , 642–660 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Чонг, М. и Драпо, П. Взаимодействие между задним мозгом и спинными сетями во время развития передвижения у рыбок данио. Дев. Нейробиол. 67 , 933–947 (2007).

    ПабМед Google ученый

  • Мэджвик, А. и др. Нейронная дифференцировка модулирует специфическую программу сплайсинга мозга позвоночных. PLoS. ОДИН 10 , e0125998 (2015).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Гахтан, Э., Тангер, П. и Байер, Х. Визуальный захват добычи личинками данио контролируется идентифицированными ретикулоспинальными нейронами ниже по течению от тектума. J. Neurosci. 25 , 9294–9303 (2005 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Дель Бене, Ф. и др. Фильтрация визуальной информации в тектуме с помощью идентифицированной нейронной цепи. Наука 330 , 669–673 (2010).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Бьянко, И. Х., Кампф, А. Р. и Энгерт, Ф.Поведение добычи, вызванное простыми визуальными стимулами у личинок рыбок данио. Перед. Сист. Неврологи. 5 , 101 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Валенте, А., Хуанг, К. Х., Португес, Р. и Энгерт, Ф. Онтогенез классического и оперантного обучающего поведения у рыбок данио. Учиться. Мем. 19 , 170–177 (2012).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Глисон, М.Р. и др. Белок трансмембранного внутреннего уха (Tmie) необходим для нормального слуха и равновесия у рыбок данио. Проц. Натл акад. науч. США 106 , 21347–21352 (2009 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Эмран, Ф. и др. Ганглиозные клетки OFF не могут управлять оптокинетическим рефлексом у рыбок данио. Проц. Натл акад. науч. США 104 , 19126–19131 (2007 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Лоу, С.Э. и др. touche Требуется для генераторных потенциалов, вызванных прикосновением, в сенсорных нейронах позвоночных. J. Neurosci. 30 , 9359–9367 (2010).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Low, S. E. et al. TRPM7 необходим сенсорным нейронам рыбок данио для активации поведения побега, вызванного прикосновением. J. Neurosci. 31 , 11633–11644 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Лоу, С.Э. и др. Реакция на прикосновения у рыбок данио требует наличия потенциалзависимого кальциевого канала 2.1b. J. Нейрофизиол. 108 , 148–159 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Спиди, Н. и Герлай, Р. Поведенческие реакции, вызванные тревожным веществом, у рыбок данио (Danio rerio). Поведение. Мозг. Рез. 188 , 168–177 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Агецума, М.и другие. Хабенула имеет решающее значение для зависимой от опыта модификации реакции страха у рыбок данио. Нац. Неврологи. 13 , 1354–1356 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Матхуру, А. С. и др. Фрагменты хондроитина являются одорантами, которые вызывают у рыб поведение страха. Курс. биол. 22 , 538–544 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Пробер Д.А. и др. Каналы TRPA1 у рыбок данио необходимы для хемоощущения, но не для термоощущения или механосенсорной функции волосковых клеток. J. Neurosci. 28 , 10102–10110 (2008 г.).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Lee, A. et al. Хабенула предотвращает беспомощное поведение личинок данио. Курс. биол. 20 , 2211–2216 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Дэрроу, К.О. и Харрис, В. А. Характеристика и развитие ухаживания у рыбок данио, Danio rerio. Рыбки данио 1 , 40–45 (2004).

    ПабМед Google ученый

  • Махабир, С., Чаттерджи, Д., Буске, К. и Герлай, Р. Созревание мелководья у двух штаммов рыбок данио: поведенческий и нейрохимический анализ. Поведение. Мозг. Рез. 247 , 1–8 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Цинь М., Вонг, А., Сегин, Д. и Герлай, Р. Индукция социального поведения у рыбок данио: живые и компьютерно анимированные рыбы в качестве стимулов. Рыбки данио 11 , 185–197 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Стюарт, А. и др. Моделирование тревоги с использованием взрослых рыбок данио: концептуальный обзор. Нейрофармакология 62 , 135–143 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Арганда, С., Перес-Эскудеро, А. и де Полавьеха, Г.Г. Общее правило для принятия решений в коллективах животных для разных видов. Проц. Натл акад. науч. США 109 , 20508–20513 (2012 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Prober, D. A., Rihel, J., Onah, A. A., Sung, R. J. & Schier, A. F. Сверхэкспрессия гипокретина/орексина вызывает у рыбок данио фенотип, подобный бессоннице. J. Neurosci. 26 , 13400–13410 (2006 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Жданова И. В. Сон у рыбок данио. Рыбки данио 3 , 215–226 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Yokogawa, T. et al. Характеристика сна у рыбок данио и бессонницы у мутантов рецептора гипокретина. PLoS Биол. 5 , e277 (2007).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Рихель, Дж.и другие. Профилирование поведения рыбок данио связывает лекарства с биологическими мишенями и регуляцией отдыха/бодрствования. Наука 327 , 348–351 (2010).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Жданова И. В., Ван С. Ю., Леклер О. У. и Данилова Н. П. Мелатонин способствует сну у рыбок данио. Мозг Res. 903 , 263–268 (2001).

    КАС пабмед Google ученый

  • Виттинг, В., Ква И.Х., Эйкеленбум П., Мирмиран М. и Свааб Д.Ф. Изменения циркадного ритма покоя-активности при старении и болезни Альцгеймера. Биол. Психиатрия 27 , 563–572 (1990).

    КАС пабмед Google ученый

  • Скин, Д. Дж. и Свааб, Д. Ф. Ритмичность мелатонина: влияние возраста и болезни Альцгеймера. Экспл. Геронтол. 38 , 199–206 (2003).

    КАС пабмед Google ученый

  • Хэтфилд, К.Ф., Герберт Дж., Ван Сомерен, Э.Дж., Ходжес, Дж.Р. и Гастингс, М.Х. Нарушение дневных циклов активности/отдыха в связи с ежедневными ритмами кортизола у домашних пациентов с ранней деменцией Альцгеймера. Мозг 127 , 1061–1074 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Ву, Ю. Х. и др. Осцилляция гена часов шишковидной железы нарушается при болезни Альцгеймера из-за функционального отключения от «главных часов». FASEB J. 20 , 1874–1876 (2006 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Ху, К., Ван Сомерен, Э. Дж., Ши, С. А. и Шеер, Ф. А. Снижение масштабной инвариантности колебаний активности при старении и болезни Альцгеймера: участие циркадного водителя ритма. Проц. Натл акад. науч. США 106 , 2490–2494 (2009 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Куган, А.Н. и др. Циркадная система при болезни Альцгеймера: нарушения, механизмы и возможности. Биол. Психиатрия 74 , 333–339 (2013).

    ПабМед Google ученый

  • Кэхилл, Г. М. Часовые механизмы у рыбок данио. Рез. клеточной ткани. 309 , 27–34 (2002).

    КАС пабмед Google ученый

  • Равашде О., de Borsetti, NH, Roman, G. & Cahill, GM. Мелатонин подавляет формирование ночной памяти у рыбок данио. Наука 318 , 1144–1146 (2007).

    КАС пабмед Google ученый

  • Кэхилл, Г. М., Херд, М. В. и Бэтчелор, М. М. Суточная ритмичность в двигательной активности личинок рыбок данио. Нейроотчет 9 , 3445–3449 (1998).

    КАС пабмед Google ученый

  • Кэхилл, Г.M. Циркадная регуляция выработки мелатонина у культивируемых рыбок данио шишковидной железы и сетчатки. Мозг Res. 708 , 177–181 (1996).

    КАС пабмед Google ученый

  • Нинкович Дж. и др. Генетическая идентификация АХЭ как положительного модулятора зависимости от психостимулятора D-амфетамина у рыбок данио. Дж. Нейробиол. 66 , 463–475 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Кэмерон, Д.Дж. и др. Связанный с болезнью Альцгеймера пептид амилоид-бета играет консервативную роль в ангиогенезе. PLoS. ОДИН 7 , e39598 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Луна, С., Кэмерон, Д. Дж. и Этелл, Д. В. Дефицит бета-амилоида и АРР вызывает серьезные цереброваскулярные дефекты: важная работа для старого злодея. PLoS. ОДИН 8 , e75052 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Доннини, С.и другие. Абета-пептиды ускоряют старение эндотелиальных клеток in vitro и in vivo, нарушая ангиогенез. FASEB J. 24 , 2385–2395 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Dujardin, S., Colin, M. & Buee, L. Приглашенный обзор: Животные модели тауопатии и их значение для исследования/перевода в клинику. Невропатология. заявл. Нейробиол. 41 , 59–80 (2015).

    КАС пабмед Google ученый

  • Бай, К. и Бертон, Э.А. Модели таупатии у рыбок данио. Биохим. Биофиз. Acta 1812 , 353–363 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Томасевич, Х. Г., Флаэрти, Д. Б., Сориа, Дж. П. и Вуд, Дж. Г. Трансгенная модель нейродегенерации рыбок данио. J. Neurosci. Рез. 70 , 734–745 (2002).

    КАС пабмед Google ученый

  • Бай, К., Гарвер, Дж. А., Хукриде, Н. А. и Бертон, Э. А. Создание трансгенной модели тауопатии рыбок данио с использованием нового промоторного элемента, полученного из гена eno2 рыбок данио. Рез. нуклеиновых кислот. 35 , 6501–6516 (2007 г.).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Бест, Дж.Д. и др. Неассоциативное обучение у личинок данио. Нейропсихофармакология 33 , 1206–1215 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Нери, Л. Р. и др. Внутрижелудочковая инъекция бета-амилоида в мозг у эмбрионов рыбок данио ухудшает когнитивные функции и увеличивает фосфорилирование тау, действие которого устраняется литием. PLoS. ОДИН 9 , e105862 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Чен Дж.и другие. Нейроповеденческая токсичность триметилолова хлорида (ТМТ) у эмбрионов рыбок данио. Нейротоксикол. Тератол. 33 , 721–726 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Нада, С. Э., Уильямс, Ф. Э. и Шах, З. А. Разработка новой и надежной фармакологической модели болезни Альцгеймера, вызванной окадаевой кислотой, у рыбок данио. Нейрол ЦНС. Беспорядок. Лекарство. Мишени 15 , 86–94 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • He, X., Zhong, Z. M. & Che, Y. [Двигательная активность и способности к обучению и памяти при болезни Альцгеймера, вызванной алюминием в кислой среде у рыбок данио]. Dongwuxue Yanjiu 33 , 231–236 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Паке Д., Шмид Б. и Хаас К.Трансгенные рыбки данио как новая животная модель для изучения таупатий и других нейродегенеративных расстройств in vivo. Нейродегенер. Дис. 7 , 99–102 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Джоши, П., Лян, Дж. О., ДиМонте, К., Салливан, Дж. и Пимпликар, С. В. Белок-предшественник амилоида необходим для конвергентно-вытяжных движений во время развития рыбок данио. Дев. биол. 335 , 1–11 (2009).

    КАС пабмед Google ученый

  • Муллан, М. и др. Патогенная мутация вероятной болезни Альцгеймера в гене APP на N-конце бета-амилоида. Нац. Жене. 1 , 345–347 (1992).

    КАС пабмед Google ученый

  • Andersen, O.M. et al. Рецептор sorLA/LR11, родственный белку сортировки нейронов, регулирует процессинг белка-предшественника амилоида. Проц. Натл акад. науч. США 102 , 13461–13466 (2005 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Рогаева Е. и др. Связанный с сортилином нейрональный рецептор SORL1 генетически связан с болезнью Альцгеймера. Нац. Жене. 39 , 168–177 (2007).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Леймер, У.и другие. Пресенилин рыбок данио (Danio rerio) способствует выработке аберрантного амилоидного бета-пептида и требует критического остатка аспартата для его функции в амилоидогенезе. Биохимия 38 , 13602–13609 (1999).

    КАС пабмед Google ученый

  • Nornes, S., Groth, C., Camp, E., Ey, P. & Lardelli, M. Контроль развития экспрессии Presenilin1, эндопротеолиза и взаимодействия у эмбрионов рыбок данио. Экспл. Сотовый рез. 289 , 124–132 (2003).

    КАС пабмед Google ученый

  • Campbell, W. A. ​​et al. Рыбки данио, лишенные энхансера пресенилина 2 Альцгеймера (Pen-2), демонстрируют чрезмерный p53-зависимый апоптоз и потерю нейронов. Дж. Нейрохим. 96 , 1423–1440 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Норнес, С.и другие. Вмешательство в сплайсинг транскриптов пресенилина оказывает сильное доминирующее негативное влияние на активность пресенилина. Гул. Мол. Жене. 17 , 402–412 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Ebrahimie, E., Moussavi Nik, S.H., Newman, M., Van Der Hoek, M. & Lardelli, M. Эквивалент изоформы PRESENILIN PS2V, связанной с болезнью Альцгеймера, у рыбок данио регулирует воспалительные и другие реакции на гипоксический стресс. J. Alzheimers Dis. 52 , 581–608 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Сундвик М., Чен Ю. К. и Панула П. Пресенилин 1 регулирует развитие и поведение гистаминовых нейронов у рыбок данио рерио. J. Neurosci. 33 , 1589–1597 (2013).

    КАС пабмед Google ученый

  • Норнес, С.и другие. Независимое и совместное действие Psen2 с Psen1 у эмбрионов рыбок данио. Экспл. Сотовый рез. 315 , 2791–2801 (2009 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • van Bebber, F., Hruscha, A., Willem, M., Schmid, B. & Haass, C. Потеря Bace2 у рыбок данио влияет на миграцию меланоцитов и отличается от фенотипов с нокаутом Bace1. Дж. Нейрохим. 127 , 471–481 (2013).

    ПабМед Google ученый

  • Ньюман, М. и др. Модель меланофора рыбок данио токсичности бета-амилоида. Рыбки данио 7 , 155–159 (2010).

    КАС пабмед Google ученый

  • Паке Д. и др. Модель таупатии у рыбок данио позволяет визуализировать гибель нейронов in vivo и оценивать лекарственные препараты. Дж. Клин. Инвестировать. 119 , 1382–1395 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Рубинштейн, А. Л. Анализы рыбок данио для скрининга токсичности лекарств. Экспертное заключение. Лекарство. Метаб. Токсикол. 2 , 231–240 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Xi, Y., Noble, S. & Ekker, M. Моделирование нейродегенерации у рыбок данио. Курс. Нейрол. Неврологи. 11 , 274–282 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Бхаттараи, П., Томас, А.К., Чжан, Ю. и Кизил, К. Влияние старения на вызванную амилоидом-бета42 нейродегенерацию и регенерацию мозга взрослых рыбок данио. Нейрогенез (Остин) 4 , e1322666 (2017).

    Google ученый

  • Бхушан, Б., Нандхагопал, С., Раджеш Каннан, Р. и Гопинат, П. Биомиметические наноматериалы: разработка покрытых белком наноцерий в качестве потенциального антиоксидантного наноагента для эффективного удаления активных форм кислорода in vitro и в модели рыбок данио. Коллоиды Surf. B Биоинтерфейсы 146 , 375–386 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Бхушан Б., Гопал Н. С., Раджеш Каннан Р. и Пакирисами Г.Терапевтический нанозим: антиоксидантное и цитопротекторное действие наноцерия против индуцированного перекисью водорода окислительного стресса в клетках фибробластов и у рыбок данио. ChemistrySelect 1 2849–2856 (2016).

  • Moritz, C., Berardi, F., Abate, C. & Peri, F. Визуализация в реальном времени раскрывает новую роль рецептора сигма-1 (sigma1) в том, что позволяет микроглии покидать повреждения головного мозга. Неврологи. лат. 591 , 13–18 (2015).

    КАС пабмед Google ученый

  • Казано, А.М., Альберт, М. и Пери, Ф. Апоптоз развития опосредует проникновение и расположение микроглии в мозге рыбок данио. Cell Rep. 16 , 897–906 (2016).

    КАС пабмед Google ученый

  • Rajesh Kannan, R. & Gp Vincent, S. Количественное определение экспрессии Pax6 на основе ELISA в развивающихся эмбрионах рыбок данио. Анна. Неврологи. 22, 171–175 (2015).

  • Риттер, Д. А., Бхатт, Д.H. & Fetcho, JR. Визуализация рыбок данио in vivo выявляет различия в спинномозговых сетях для побега и плавательных движений. J. Neurosci. 21 , 8956–8965 (2001).

    КАС пабмед Google ученый

  • Фридрих, Р. В. и Коршинг, С. И. Комбинаторное и хемотопическое кодирование запахов в обонятельной луковице рыбок данио, визуализируемое с помощью оптического изображения. Нейрон 18 , 737–752 (1997).

    КАС Google ученый

  • См. K. et al. Дефицит SMN изменяет экспрессию Nrxn2 и сплайсинг у рыбок данио и мышиных моделей спинальной мышечной атрофии. Гул. Мол. Жене. 23 , 1754–1770 (2014).

    КАС пабмед Google ученый

  • Ким М.Дж., Канг К.Х., Ким С.Х. и Чой С.Ю. Визуализация митохондрий в реальном времени у трансгенных рыбок данио, экспрессирующих митохондриально направленный GFP. Biotechniques 45 , 331–334 (2008).

    ПабМед Google ученый

  • O’Donnell, K.C., Vargas, M.E. & Sagasti, A. WldS и PGC-1alpha регулируют митохондриальный транспорт и состояние окисления после повреждения аксонов. J. Neurosci. 33 , 14778–14790 (2013).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кодзава С.и другие. Прогнозирование в реальном времени времени деления клеток у развивающихся эмбрионов рыбок данио. науч. Респ. 6 , 32962 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Вильегас, Р. и др. Динамика дегенерации и регенерации развивающихся периферических аксонов рыбок данио выявляет потребность во внешних типах клеток. Нейронная разработка. 7 , 19 (2012).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кеттунен, П.Визуализация кальция у рыбок данио. Доп. Эксп. Мед. биол. 740 , 1039–1071 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Такахаши М., Нарушима М. и Ода Ю. In vivo визуализация функциональных тормозных сетей на маутнеровских клетках личинок рыбок данио. J. Neurosci. 22 , 3929–3938 (2002).

    КАС пабмед Google ученый

  • Гахтан Э., Санкрити, Н., Кампос, Дж. Б. и О’Мэлли, Д. М. Доказательства широко распространенной сети побега ствола мозга у личинок рыбок данио. J. Нейрофизиол. 87 , 608–614 (2002).

    ПабМед Google ученый

  • Симомура О., Иноуе С., Мусики Б. и Киши Ю. Рекомбинантный экворин и рекомбинантные полусинтетические экворины. Клеточные индикаторы ионов Ca2 + . Биохим. J. 270 , 309–312 (1990).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Creton, R., Steele, M.E. & Jaffe, L.F. Экспрессия апо-экворина во время эмбрионального развития; сколько нужно для визуализации кальция? Cell Calcium 22 , 439–446 (1997).

    КАС пабмед Google ученый

  • Шимомура О., Мусики Б., Киши Ю. и Иноуэ С.Светоизлучающие свойства рекомбинантных полусинтетических экворинов и рекомбинантного флуоресцеин-конъюгированного аэкворина для измерения клеточного кальция. Cell Calcium 14 , 373–378 (1993).

    КАС пабмед Google ученый

  • Wachowiak, M., Denk, W. & Friedrich, R.W. Функциональная организация сенсорного входа в клубочек обонятельной луковицы, проанализированная с помощью двухфотонной визуализации кальция. Проц. Натл акад.науч. США 101 , 9097–9102 (2004 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Якси, Э., Юдкевиц, Б. и Фридрих, Р. В. Топологическая реорганизация представлений запаха в обонятельной луковице. PLoS Биол. 5 , е178 (2007).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Хигасидзима С., Масино М. А., Мандель, Г. и Фетчо, Дж. Р. Визуализация активности нейронов во время поведения рыбок данио с помощью генетически кодируемого индикатора кальция. J. Нейрофизиол. 90 , 3986–3997 (2003 г.).

    ПабМед Google ученый

  • Vargas, M.E., Yamagishi, Y., Tessier-Lavigne, M. & Sagasti, A. Живая визуализация динамики кальция во время дегенерации аксона выявляет две функционально различные фазы притока кальция. J. Neurosci. 35 , 15026–15038 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • O’Donnell, K.C. et al. Дегенерация аксонов и опосредованная PGC-1 альфа защита в модели токсичности альфа-синуклеина у рыбок данио. Дис. Модели и мех. 7 , 571–582 (2014).

    Google ученый

  • Луенго-Орос, Массачусетс, Ледесма-Карбайо, М.Дж., Пейрьерас, Н. и Сантос, А. Анализ изображений для понимания развития эмбриона: мост от микроскопии к биологическим знаниям. Курс. мнение Жене. Дев. 21 , 630–637 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Келлер, П.Дж., Шмидт, А.Д., Виттбродт, Дж. и Стельцер, Э.Х. Реконструкция раннего эмбрионального развития рыбок данио с помощью сканирующей световой микроскопии. Наука 322 , 1065–1069 (2008).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Hammers, M.D. et al. Яркий флуоресцентный зонд для h3S позволяет получать чувствительные к аналитам трехмерные изображения живых рыбок данио с помощью световой флуоресцентной микроскопии. Дж. Ам. хим. соц. 137 , 10216–10223 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Гуо Ю., Венеман, В. Дж., Спаник, Х. П. и Вербек, Ф. Дж. Трехмерная реконструкция и измерения личинок рыбок данио на основе высокопроизводительной аксиальной визуализации in vivo. Биомед. Опц. Экспресс 8 , 2611–2634 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Микут, Р. и др. Автоматизированная обработка данных визуализации рыбок данио: опрос. Рыбки данио 10 , 401–421 (2013).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Алессандри, К.и другие. Универсальная камера для микроскопии, напечатанная на 3D-принтере, для получения многомерных изображений, UniverSlide. науч. Респ. 7 , 42378 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Лессман, Калифорния. Развивающиеся рыбки данио (Danio rerio): модель позвоночных для высокопроизводительного скрининга химических библиотек. Исследование врожденных дефектов. Врожденные дефекты Res. C Embryo Today.: Rev. 93 , 268–280 (2011).

    КАС Google ученый

  • Guo, S. Использование рыбок данио для оценки влияния лекарств на развитие и функцию нервной системы. Экспертное заключение. Препарат Дисков. 4 , 715–726 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Скальцо, Ф. М. и Левин, Э. Д. Использование данио рерио (Danio rerio) в качестве модельной системы в нейроповеденческой токсикологии. Нейротоксикол. Тератол. 26 , 707–708 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Парнг, К., Рой, Н.М., Тон, К., Лин, Ю. и МакГрат, П. Оценка нейротоксичности с использованием рыбок данио. J. Pharmacol. Токсикол. Методы 55 , 103–112 (2007).

    КАС пабмед Google ученый

  • Линни Э., Апчерч Л.& Donerly, S. Zebrafish как нейротоксикологическая модель. Нейротоксикол. Тератол. 26 , 709–718 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Parng, C., Ton, C., Lin, Y.X., Roy, N.M. & McGrath, P. Анализ рыбок данио для выявления нейропротекторов in vivo. Нейротоксикол. Тератол. 28 , 509–516 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Питчай, А., Gnana, S., Vincent, P., Rajaretinam & Rajesh Kannan, R. Выделение с помощью ВЭЖХ-ФДА и обнаружение с помощью ЖХ-МС/МС флавоноида, ингибирующего ацетилхолинэстеразу, из Tephrosia purpurea (L.) Pers. в мозгу рыбок данио. Индиан Дж Биохим. Биофиз. 53 ,104–11 (2016).

  • Менелау, Э. и Свобода, К. Р. Вторичные мотонейроны у молодых и взрослых рыбок данио: ошибки поиска пути аксонов, вызванные воздействием никотина на эмбрион. Дж. Комп. Нейрол. 512 , 305–322 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Билотта, Дж., Барнетт, Дж. А., Хэнкок, Л. и Сазик, С. Воздействие этанола изменяет развитие рыбок данио: новая модель фетального алкогольного синдрома. Нейротоксикол. Тератол. 26 , 737–743 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Darland, T. & Dowling, J.E. Поведенческий скрининг на чувствительность к кокаину у мутагенизированных рыбок данио. Проц. Натл акад. наук США 98 , 11691–11696 (2001 г.).

    КАС пабмед Google ученый

  • Лопес-Патино, М. А., Ю. Л., Кабрал, Х. и Жданова, И. В. Анксиогенные эффекты отмены кокаина у рыбок данио. Физиол. Поведение 93 , 160–171 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Лау, Б., Брето, С., Huang, Y., Lin, E. & Guo, S. Диссоциация предпочтений в еде и опиоидах из-за генетической мутации у рыбок данио. Гены. Мозг. Поведение 5 , 497–505 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Брето, С. и др. Поведение при выборе морфина показывает зависимое от опыта предпочтение наркотиков и основные нервные субстраты у развивающихся личинок рыбок данио. Неврология 146 , 1109–1116 (2007).

    КАС пабмед Google ученый

  • Gerlai, R., Lahav, M., Guo, S. & Rosenthal, A. Пьет как рыба: рыба-зебра (Danio rerio) как генетическая модель поведения для изучения воздействия алкоголя. Фармакол. Биохим. Поведение 67 , 773–782 (2000).

    КАС пабмед Google ученый

  • Локвуд Б., Бьерке С., Кобаяши К. и Го С.Острое воздействие алкоголя на личинок рыбок данио: генетическая система для крупномасштабного скрининга. Фармакол. Биохим. Поведение 77 , 647–654 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Левин, Э. Д., Лимпуангтип, Дж., Рачаконда, Т. и Петерсон, М. Время влияния никотина на обучение у рыбок данио. Психофармакол. (Берл.) 184 , 547–552 (2006).

    КАС Google ученый

  • Север, Т.Э. и др. Простагландин Е2 регулирует гомеостаз гемопоэтических стволовых клеток позвоночных. Природа 447 , 1007–1011 (2007).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Stern, H.M. et al. Небольшие молекулы, которые задерживают S-фазу, подавляют мутант bmyb у рыбок данио. Нац. хим. биол. 1 , 366–370 (2005).

    КАС пабмед Google ученый

  • Петерсон Р.Т. и др. Химическое подавление генетической мутации в модели коарктации аорты у рыбок данио. Нац. Биотехнолог. 22 , 595–599 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Burns, C.G. et al. Высокопроизводительный анализ малых молекул, модулирующих частоту сердечных сокращений эмбрионов рыбок данио. Нац. хим. биол. 1 , 263–264 (2005).

    КАС пабмед Google ученый

  • Тон, С., Lin, Y. & Willett, C. Рыбки данио в качестве модели для тестирования нейротоксичности при развитии. Рождение. Дефекты Рез. А. Клин. Мол. Тератол. 76 , 553–567 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Langheinrich, U. Рыбка данио: новая модель на фармацевтическом подиуме. Bioessays 25 , 904–912 (2003).

    КАС пабмед Google ученый

  • Милан, Д.Дж., Петерсон, Т.А., Раскин, Дж.Н., Петерсон, Р.Т. и Макрей, К.А. Лекарства, вызывающие нарушения реполяризации, вызывают брадикардию у рыбок данио. Тираж 107 , 1355–1358 (2003 г.).

    ПабМед Google ученый

  • Cachat, J. et al. Трехмерное нейрофенотипирование поведения взрослых рыбок данио. PLoS. ОДИН 6 , e17597 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Гроссман, Л.и другие. Влияние пирацетама на поведение и память взрослых рыбок данио. Мозг Res. Бык. 85 , 58–63 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Стюарт, А. и др. Поведенческие эффекты МДМА («экстази») на взрослых рыбок данио. Поведение. Фармакол. 22 , 275–280 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кызар Э.Дж. и др. Влияние галлюциногенных агентов мескалина и фенциклидина на поведение и физиологию рыбок данио. Прог. Нейропсихофармакол. биол. Психиатрия 37 , 194–202 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Williams, L. R. et al. Поведенческие и физиологические эффекты гексогена на взрослых рыбок данио. Комп. Биохим. Физиол. С. Токсикол. Фармакол. 155 , 33–38 (2012).

    КАС пабмед Google ученый

  • Robinson, K. S. et al. Психофармакологические эффекты острого воздействия кинуреновой кислоты (KYNA) на рыбок данио. Фармакол. Биохим. Поведение 108 , 54–60 (2013).

    КАС пабмед Google ученый

  • Бруни Г., Лахани П. и Кокель Д. Открытие новых нейроактивных препаратов с помощью высокопроизводительного химического скрининга на основе поведения у рыбок данио. Перед. Фармакол. 5 , 153 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Раджаретинам, Р. К. и Самуэль Гнана, П. В. Быстрый нейроповеденческий анализ, основанный на эффектах ингибитора ацетилхолинэстеразы из Tephrosia purpurea у рыбок данио. Энн. Неврологи. 19 , 8–13 (2012).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Аннило Т.и другие. Эволюция семейства генов ABC позвоночных: анализ рождения и гибели генов. Геномика 88 , 1–11 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Fischer, S. et al. Abcb4 действует как переносчик мультиксенобиотиков и активный барьер против поглощения химических веществ эмбрионами рыбок данио (Danio rerio). БМС Биол. 11 , 69 (2013).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Лонг Ю., Li, Q. & Cui, Z. Молекулярный анализ и детоксикация тяжелыми металлами ABCC1/MRP1 у рыбок данио. Мол. биол. Респ. 38 , 1703–1711 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Флеминг А., Дикманн Х. и Голдсмит П. Функциональная характеристика созревания гематоэнцефалического барьера у личинок данио. PLoS. ОДИН 8 , e77548 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Чон, Дж.Ю. и др. Функциональный анализ и анализ развития гематоэнцефалического барьера у рыбок данио. Мозг Res. Бык. 75 , 619–628 (2008).

    КАС пабмед Google ученый

  • Цзэн А. и др. Определите гематоэнцефалический барьер, проникающий через лекарство-TNB, используя модель ксенотрансплантата ортотопической глообластомы данио. науч. Респ. 7 , 14372 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Шойнер, Д.и другие. Уровень секретируемого бета-амилоидного белка, сходного с таковым в сенильных бляшках при болезни Альцгеймера, увеличивается in vivo за счет мутаций пресенилина 1 и 2 и АРР, связанных с семейной болезнью Альцгеймера. Нац. Мед. 2 , 864–870 (1996).

    КАС пабмед Google ученый

  • Murphy, M. P. & LeVine, H. 3-я болезнь Альцгеймера и бета-амилоидный пептид. J. Alzheimers Dis. 19 , 311–323 (2010).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Carter, J. & Lippa, C. F. Бета-амилоид, гибель нейронов и болезнь Альцгеймера. Курс. Мол. Мед. 1 , 733–737 (2001).

    КАС пабмед Google ученый

  • Виола К.Л. и Кляйн В.Л. Бета-амилоидные олигомеры в патогенезе, лечении и диагностике болезни Альцгеймера. Акта Нейропатол. 129 , 183–206 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Харди, Дж. Болезнь Альцгеймера: гипотеза амилоидного каскада: обновление и переоценка. J. Alzheimers Dis. 9 , 151–153 (2006).

    КАС пабмед Google ученый

  • Палоп, Дж. Дж. и Маке, Л.Бета-амилоид-индуцированная дисфункция нейронов при болезни Альцгеймера: от синапсов к нейронным сетям. Нац. Неврологи. 13 , 812–818 (2010).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Редди, П. Х. и Бил, М. Ф. Бета-амилоид, митохондриальная дисфункция и синаптическое повреждение: последствия снижения когнитивных функций при старении и болезни Альцгеймера. Тенденции Мол. Мед. 14 , 45–53 (2008).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Bayer, T. A. & Wirths, O. Внутриклеточное накопление бета-амилоида — предиктор синаптической дисфункции и потери нейронов при болезни Альцгеймера. Перед. Стареющие нейроски. 2 , 8 (2010).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Ци, X. М. и Ма, Дж.F. Роль клиренса бета-амилоида при церебральной амилоидной ангиопатии: больше потенциальных терапевтических целей. Пер. Нейродегенер. 6 , 22 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google ученый

  • Smith, E.E. & Greenberg, S.M. Бета-амилоид, кровеносные сосуды и функция мозга. Ход 40 , 2601–2606 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Мюллер, Т., Vernier, P. & Wullimann, MF. Центральная нервная холинергическая система взрослого животного с нейрогенной моделью, рыбки данио Danio rerio. Мозг Res. 1011 , 156–169 (2004).

    КАС пабмед Google ученый

  • Ньюман М., Вердиль Г., Мартинс Р. Н. и Ларделли М. Рыбки данио как инструмент исследования болезни Альцгеймера. Биохим. Биофиз. Acta 1812 , 346–352 (2011).

    КАС пабмед Google ученый

  • Эталонная последовательность генома рыбки данио и ее связь с геномом человека

    Рыбка данио ( Danio rerio ) была впервые идентифицирована как генетически податливый организм в 1980-х годах. Систематическое применение генетических скринингов привело к фенотипической характеристике большого набора мутаций 1,2 . Эти мутации, приводящие к гомозиготности, могут вызывать дефекты в различных системах органов с патологиями, подобными человеческим заболеваниям.Такие исследования также внесли значительный вклад в наше понимание основной биологии позвоночных и их развития. В дополнение к возможности систематического определения большого диапазона фенотипов раннего развития, скрининг у рыбок данио способствовал более общему пониманию факторов, контролирующих спецификацию типов клеток, систем органов и осей тела позвоночных 7,8,9 .

    Хотя его вклад уже был существенным, исследования рыбок данио обещают улучшить наше понимание детальной роли конкретных генов в заболеваниях человека, как редких, так и распространенных.Все чаще эксперименты с рыбками данио включаются в исследования генетических заболеваний человека, часто обеспечивая независимую проверку активности гена, связанного с заболеванием человека 3,5,10 . Существенным для этого предприятия является высококачественная последовательность генома и полная аннотация генов, кодирующих белок рыбок данио, с идентификацией их человеческих ортологов.

    Проект секвенирования генома рыбок данио был начат в Wellcome Trust Sanger Institute в 2001 году. Мы выбрали Tübingen в качестве эталонного штамма рыбок данио, так как он широко использовался для выявления мутаций, влияющих на эмбриогенез 2 .Наша стратегия напоминала подход к секвенированию клон за клоном, принятый ранее для проектов генома человека и мыши. Сборка Zv9 представляет собой гибрид высококачественной последовательности готового клона (83%) и последовательности полногеномного дробовика (WGS) (17%), с общим размером 1,412 гигабаза (Гб) (таблица 1). Клон и последовательность WGS привязаны к мейотической карте с высоким разрешением и высокой плотностью, называемой картой Sanger AB Tübingen (SATmap), названной в честь штаммов рыбок данио, использованных для создания карты (дополнительная информация).

    Таблица 1 Статистика сборки и аннотации для сборки Zv9

    Рыбки данио являются членами инфракласса teleostei, монофилетической группы, которая, как считается, возникла примерно 340 миллионов лет назад от общего предка 11 . По сравнению с другими видами позвоночных этот предок подвергся дополнительному раунду дупликации всего генома (WGD), называемой специфической дупликацией генома костистых костей (TSD) 12 . Дубликаты генов, возникающие в результате этого процесса, называются онологами (в честь Сусуму Оно, предложившего этот механизм дупликации генов) 13 .Рыбки данио обладают 26 206 кодирующими белок генами 6 , больше, чем у любого ранее секвенированного позвоночного, и они имеют большее количество видоспецифичных генов в своем геноме, чем человек, мышь или курица. Часть этого увеличенного количества генов, вероятно, является следствием TSD.

    Прямое сравнение генов рыбок данио и человека, кодирующих белок, выявило ряд интересных особенностей. Во-первых, 71,4% генов человека имеют по крайней мере одного ортолога рыбок данио, как определено Ensembl Compara 14 (таблица 2).И наоборот, 69% генов рыбок данио имеют по крайней мере одного человеческого ортолога. Среди ортологичных генов 47% генов человека имеют отношение один к одному с ортологом рыбок данио. Второй по величине ортологический класс содержит гены человека, которые связаны со многими генами рыбок данио (класс «один человек ко многим рыбкам данио»), в среднем 2,28 гена рыбок данио на каждый человеческий ген, и это, вероятно, отражает TSD. Несколько известных человеческих генов не имеют четко идентифицируемого ортолога рыбок данио; например, гены фактора ингибирования лейкемии ( LIF ), онкостатина M ( OSM ) или интерлейкина-6 ( IL6 ), хотя рецепторы lifra, lifrb, osmr и il6r явно присутствуют в геном рыбки данио.Возможно, существуют белки рыбок данио с функционально сходной активностью с LIF, OSM и IL-6, но расхождение их последовательностей настолько велико, что их нельзя признать ортологами. Точно так же геном рыбки данио не имеет ортолога BRCA1 , но имеет ортолог BRCA1 , связанный с геном BARD1 , который кодирует ассоциированный и функционально сходный белок, и ген brca2 , который играет важную роль в развитие ооцита, что, вероятно, отражает его роль в восстановлении повреждений ДНК 15 .

    Таблица 2. Сравнение генов, кодирующих белки человека и рыбок данио, и их ортологических взаимосвязей

    Рыбы данио успешно использовались для более подробного изучения биологической активности генов, ортологичных генам, связанным с заболеваниями человека 3,4,5 . Чтобы исследовать количество генов, потенциально связанных с заболеванием, мы сравнили список генов человека, обладающих по крайней мере одним ортологом рыбок данио, с 3176 генами, имеющими описания заболеваемости, которые перечислены в базе данных Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM).Из этих болезненных генов 2601 (82%) могут быть связаны по крайней мере с одним ортологом рыбок данио. Аналогичное сравнение выявило по крайней мере одного ортолога рыбок данио для 3075 (76%) из 4023 генов человека, участвующих в полногеномных ассоциативных исследованиях (GWAS).

    Zv9 показывает общее содержание повторов 52,2%, что является самым высоким зарегистрированным показателем у позвоночных. Все другие секвенированные костистые рыбы демонстрируют гораздо более низкое содержание повторов, в среднем менее 30%. Этот результат предполагает, что эволюционный путь, ведущий к рыбкам данио, претерпевал увеличение количества повторов, чему, возможно, способствовало узкое место в популяции.В качестве альтернативы, содержание повторов других секвенированных видов костистых костей может быть недостаточно представлено, поскольку эти сборки в основном представляют собой WGS 16 .

    Большинство мобильных элементов, обнаруженных в геноме человека, относятся к типу I (ретромобильные элементы) с более чем 4,3 миллионами позиций, покрывающих 44% последовательности, в то время как только 11% последовательности генома рыбок данио покрыты элементами типа I в менее более 500 000 экземпляров. Напротив, геном рыбок данио содержит заметный избыток мобильных элементов ДНК типа II.Действительно, 2,3 миллиона экземпляров мобильных элементов ДНК типа II покрывают 39% последовательности генома рыбок данио (дополнительная таблица 12), тогда как повторы типа II покрывают только 3,2% генома человека.

    Такое ярко выраженное изобилие мобильных элементов типа II является уникальным среди секвенированных геномов позвоночных, и последовательность генома свидетельствует о недавно активных мобильных элементах типа II. Ближайшим видом позвоночных по обилию мобильных элементов типа II является Xenopus tropicalis (25% мобильных элементов типа II), тогда как секвенированные и аннотированные костистые рыбы (иглобрюх Takifugu и Tetraodon , трехиглая колюшка ( Gasterosteus aculeatus ) и медака ( Oryzias latipes )) обладают покрытием мобильными элементами типа II менее 10%, что может быть связано с тем фактом, что геном рыбки данио отличается в основном от других секвенированных и аннотированных геномов костистых рыб. 17 .Мобильные элементы данио типа II делятся на 14 надсемейств с 401 семейством повторов в общей сложности (дополнительная таблица 12). Суперсемейства ДНК и hAT являются наиболее многочисленными и разнообразными в геноме рыбок данио, вместе покрывая 28% последовательности. Обилие мобильных элементов типа II у рыбок данио или отсутствие ретромобильных элементов может объяснить низкое содержание псевдогенов рыбок данио (дополнительная таблица 14).

    Длинное плечо хромосомы 4 является уникальным среди геномных областей рыбок данио из-за относительного отсутствия генов, кодирующих белок, и обширного гетерохроматина.Хромосома 4, как известно, поздно реплицируется, и исследования гибридизации предполагают, что геномные копии 5S рибосомной ДНК (рДНК), которые заметно не присутствуют ни на одной другой хромосоме, разбросаны по длинному плечу с высокой избыточностью 18 . Сразу после предполагаемой центромеры примерно на 24 мегабазах (Mb) ландшафт последовательности (рис. 1 и дополнительная рис. A4) показывает заметное увеличение содержания повторов, которое продолжается до теломеры длинного плеча. Приблизительно на 27  Мб в остальном равномерное присутствие сателлитного повтора SAT-2 на длинном плече резко обрывается.Это местоположение также является отправной точкой равномерного распределения MOSAT-2, сателлитного повтора, который почти отсутствует во всех других хромосомах, но сильно обогащен на длинном плече хромосомы 4. Субтеломерная область длинного плеча показывает отчетливое распределение повторяющихся элементов. , с относительно меньшим количеством вкрапленных элементов и повышенным содержанием сателлитных, простых и тандемных повторов, которые не содержат последовательностей 5S рДНК. Кроме того, на длинном плече снижено содержание гена и немного повышено содержание гуанина-цитозина.

    Рисунок 1: Ландшафт хромосомы 4.

    a , покрытие экзонами (синие), совмещенные с покрытием экзонами мяРНК (черные). b , Составное покрытие повторов, разделенное на подвижные элементы типа I (красные), подвижные элементы типа II (серые) и другие типы повторов (синие), включая пылевые, тандемные и спутниковые повторы. c , Состав последовательности (серые столбцы, клоны; синие столбцы, контиги WGS). d , Размещение генетических маркеров (красный, маркеры SATmap; синий, маркеры мейотической карты теплового шока; черный, маркеры мейотической карты Массачусетской больницы общего профиля).Размещение маркеров было нормализовано, чтобы можно было сравнивать карты. Околоцентромерные клоны расположены на 20 Mb (BX537156), 20,2 Mb (Z10280) и 24,4 Mb (Z20450) 28 . Ось x   показывает положение хромосомы в Mb. a и b рассчитывались как процентное покрытие перекрывающихся окон размером 1 Мб (оси и ) со сдвигом 100 кб между каждым окном. c и d были рассчитаны для окон размером 100 КБ. Ось y для d показывает нормализацию позиций маркеров относительно диапазона отдельной карты.Аналогичные графики для другой хромосомы представлены в дополнительной информации.

    Слайд PowerPoint

    Длинное плечо хромосомы 4 также имеет особую структуру в отношении ортологии генов и синтении. Приблизительно 80% присутствующих генов не имеют идентифицируемых ортологов у человека. Фактически, 110 генов (из 663) не имеют идентифицируемых ортологов в каком-либо другом секвенированном геноме костистых рыб и действительно кажутся специфичными для рыбок данио.Гены в этом регионе сильно дуплицированы: только 31 семейство генов предков обеспечивает 77,5% генов, самый крупный из которых содержит не менее 109 дубликатов в этом регионе. Самые большие из этих семейств соответствуют NOD-подобным рецепторным белкам 19 с предполагаемой ролью во врожденном иммунитете и белкам цинковых пальцев. Мы также наблюдали очень высокую плотность малых ядерных РНК (snRNAs) на хромосоме 4 и, в частности, тех, которые кодируют компоненты сплайсосомы. Когорта мяРНК, находящихся на длинном плече хромосомы 4, составляет 53.2% всех мяРНК в геноме рыбок данио. Кроме того, у особой группы рыбок данио, полученных недавно из естественной популяции, было обнаружено, что субтеломерная область длинного плеча хромосомы 4 содержит главную детерминанту пола с аллелями, которые на 100 % предсказывают развитие самцов и на 85 % предсказывают развитие самцов. женского развития, предполагая, что эта хромосома может быть, могла быть или может стать половой хромосомой в этой конкретной популяции 20 .

    В дополнение к детерминанте пола хромосомы 4, три других отдельных геномных региона были идентифицированы как влияющие на определение пола, и они различаются между штаммами и даже внутри изучаемых семейств 20,21 .Наша мейотическая карта, SATmap, которая была создана для закрепления геномной последовательности, предоставила возможность изучить, есть ли какие-либо сильные сигналы для определения пола. Для создания SATmap мы воспользовались тем фактом, что можно создать двойных гаплоидных особей, которые содержат только материнскую ДНК, гомозиготных по каждому локусу и которых можно выращивать до тех пор, пока они не станут фертильными 22 (рис. 2а). Чтобы исследовать интересное открытие, что рыба SATmap F 1 может быть как самцом, так и самкой, будучи генетически идентичными и гетерозиготными по каждому полиморфному локусу, мы искали генетический сигнал для определения пола в поколении F 2 , в котором эти полиморфизмы сегрегируют. .Используя морфологические вторичные половые признаки, мы смогли определить пол 332 генотипированных особей F 2 . Хотя большинство хромосом не демонстрировали значительного генетического смещения для определенного пола, мы обнаружили, что большая часть хромосомы 16 несет сильный сигнал ( P = 9,1 × 10 −7 ) с широким пиком вокруг центромеры (рис. 2b, c). ). Гомозиготы по аллелю Тюбинген (бабушка-материнство) с очень высокой вероятностью были женщинами, тогда как гомозиготы по аллелю АВ (дедушка-отец) вряд ли были женщинами (рис.2).

    Рисунок 2: Сигнал определения пола на хромосоме 16.

    a , Схема разведения для SATmap. Основатели нулевого поколения двойных гаплоидов (G 0 ) были секвенированы примерно на 40-кратную глубину с использованием технологии Illumina GAII. Мы обнаружили около 7 миллионов SNP между двумя основателями SATmap. Это количество SNP только между двумя гомозиготными особями рыбок данио намного превышает количество, наблюдаемое между любыми двумя людьми, и составляет почти одну пятую всех SNP, измеренных среди 1092 человеческих диплоидных геномов 29 .Генетически идентичные, гетерозиготные F 1 рыбы обоего пола произошли от скрещивания предков. Индивидуумы F 1 были скрещены, чтобы создать панель из F 2 индивидуумов, каждый со своим уникальным набором мейотических рекомбинаций между хромосомами AB и Tübingen (Tü), которые были обнаружены с помощью плотного генотипирования с набором из 140 306 SNP, покрывающих большую часть генома. b , Полногеномный P  значения тестов генотипических различий между полами, упорядоченные по хромосомам.Пунктирная линия соответствует различиям, которые ожидаются один раз на 100 случайных сканирований генома, а пунктирная линия соответствует различиям, ожидаемым один раз на 1000 случайных сканирований генома. Единственный локус, который является статистически значимым на этих уровнях, находится на хромосоме 16. c , частоты генотипов для мужчин и женщин на хромосоме 16. Серая линия на уровне 0,5 соответствует ожидаемому для гетерозигот (сплошные линии), а серая линия на уровне 0,25 соответствует к ожиданию гомозигот (штриховая и пунктирная линии).Светло-серая заштрихованная рамка соответствует области, в которой эмпирическое P  < 0,01, темно-серая заштрихованная рамка соответствует области, в которой P  < 0,001.

    Слайд PowerPoint

    Количество генов, кодирующих белок, у позвоночных относительно стабильно, хотя даже близкородственные виды могут демонстрировать большие различия в характере содержания генов, кодирующих белок. Мы провели четырехстороннее сравнение протеома двух млекопитающих (человека и мыши), птицы (курицы) и рыбки данио, чтобы количественно определить долю общих и видоспецифичных генов, присутствующих в каждом геноме (рис.3а). Основная группа из 10 660 генов обнаружена у всех четырех видов и, вероятно, соответствует основному набору генов, кодирующих белки позвоночных. Это число несколько меньше, чем базовый набор из 11 809 генов позвоночных, идентифицированных ранее как общие для трех геномов рыб ( Tetraodon , медака, данио) и трех амниот (человек, мышь, курица) 16 , но расхождение, вероятно, отражает улучшенная аннотация этих геномов, которая часто приводит к слиянию фрагментированных структур генов.Каждый таксон имеет от 2596 до 3634 видоспецифичных генов. Заметный избыток, наблюдаемый у рыбок данио, может быть следствием WGD, потому что пары дуплицированных генов, которые произошли от WGD, но не имеют ортолога у амниот, считаются двумя специфическими генами. Кроме того, у человека, мыши и рыбки данио обнаружено 2059 генов, но не у курицы, и это число в два раза превышает количество генов, обнаруженных у всех амниот, но не у рыбок данио (892). Неясно, были ли эти гены потеряны на эволюционной ветви, ведущей к курице, или это связано с ошибками аннотации или ортологии в геноме курицы.

    Рисунок 3: Эволюционные аспекты генома рыбок данио.

    a , Ортологические гены, общие для геномов рыбок данио, человека, мыши и курицы, с использованием ортологических взаимосвязей из Ensembl Compara 63. Гены, общие для разных видов, рассматриваются с точки зрения копий на момент разделения. Например, ген, существующий в одной копии у рыбок данио, но продублированный в человеческой линии, будет считаться только одним общим геном в перекрытии. b , Онологические отношения между хромосомами рыбок данио.Хромосомы представлены в виде цветных блоков. Положение однородных генов между хромосомами выделено серым цветом (для ясности ссылки между хромосомами, имеющими менее 20 общих генов, не показаны). Изображение было получено с помощью Circos 30 .

    Слайд PowerPoint

    Мы идентифицировали блоки двойной консервативной синтении (DCS) между всеми секвенированными четвероногими и четырьмя геномами рыб (зебрафиш, медака, колюшка и Tetraodon ).Блоки DCS определяются как наборы генов у недублированных видов, которые обнаруживаются на двух разных хромосомах у видов, подвергшихся WGD 23 , хотя гены могут не быть соседними у дуплицированных видов 24 . DCS между рыбками данио и человеком представлены по обе стороны от каждой человеческой хромосомы (дополнительная рис. 15). Используя блоки DCS, мы идентифицировали паралогичные гены рыбок данио, которые являются частью блоков DCS и согласуются с локально чередующимися хромосомами, следовательно, с происхождением в TSD.Мы идентифицировали 3440 пар таких онологов (26% всех генов), всего 8083 гена с учетом последующих дупликаций. Примечательно, что хотя истинные пары онологов могут существовать в пределах одной и той же хромосомы за счет перестроек после ТСД, мы исключили такие случаи, поскольку не можем надежно отличить их от сегментарных дупликаций. Это количество предковых генов, сохраняемых в виде дубликатов у рыбок данио, выше, как в абсолютном количестве, так и в пропорции, чем в геномах других рыб (критерий хи-квадрат, все P  < 3 × 10 -5 ).

    Мы сравнили 8083 человека-онологов TSD рыбок данио с людьми-онологами, происходящими из двух раундов WGD, которые являются общими для всех позвоночных, и обнаружили, что эти два набора сильно перекрываются (критерий хи-квадрат, P  <2 × 10 −16 ). В целом, пары, родственные рыбкам данио, обогащены специфическими функциями (нейронная активность, факторы транскрипции) и ортологичны генам млекопитающих, находящимся под более сильными эволюционными ограничениями, чем гены, утратившие свою вторую копию.

    Круговое представление пар онологов (рис. 3b) выделяет хромосомы или части хромосом, которые произошли от одной и той же додупликативной предковой хромосомы (например, хромосомы 3 и 12, 17 и 20, 16 и 19). Среди хромосом рыбок данио хромосомы 16 и 19 уникальны тем, что сохраняют синтению один к одному. В соответствии с сохранением синтении, хромосома 16 и хромосома 19 обладают кластерами ортологов генов, связанных с главным комплексом гистосовместимости (MHC) млекопитающих, а также кластерами hoxab и hoxaa соответственно, каждый из которых ортологичен человеческому. HOXA блок 25 .

    С тех пор, как в 2002 году была обнародована самая ранняя сборка цельного генома, состоящая только из дробовика, эталонная последовательность генома рыбок данио позволила сделать много новых открытий, в частности, позиционное клонирование сотен генов из мутаций, влияющих на эмбриогенез, поведение, физиологию и здоровье и болезнь. Кроме того, аннотированный эталонный геном позволил создать точные реагенты для обогащения всего экзома, которые ускоряют как проекты позиционного клонирования, так и усилия по открытию новых мутаций в масштабе всего генома 26,27 .Хотя секвенирование эталонного генома рыбок данио завершено, остается несколько плохо собранных областей, которые разрешаются консорциумом по эталонным геномам (http://genomereference.org).

    Обзор — Центр рыб данио — Исследование клиники Мэйо

    Обзор

    Рыбка данио (Danio rerio) является ведущим модельным организмом позвоночных животных, не относящимся к млекопитающим. Эта маленькая водная рыба используется в различных дисциплинах сообществом Майо и более чем тысячей лабораторий по всему миру из-за ее биологического сходства с человеком, передовой молекулярной генетики, выяснения последовательности ее генома, а также постоянно расширяющихся и выдающихся новых биологические инструменты теперь доступны исследователям рыбок данио.

    Рыбки данио — выдающаяся система для изучения процессов, которые трудно или невозможно проследить у других животных, таких как механизмы, лежащие в основе органогенеза. В отличие от мышей, эта модельная система легко поддается применению подходов генетического мутагенеза для идентификации новых генов, необходимых для этих ключевых процессов и функций развития. В области биологии развития позвоночных и функциональной геномики прозрачность эмбриона рыбок данио во время развития позволила исследователям отслеживать регуляцию экспрессии генов с помощью генов флуоресцентных белков в реальном времени у живых животных.Следовательно, преобразование генетической и другой биологической информации, полученной от рыб, в человека происходило быстрее, чем в других системах позвоночных.

    Растущее сообщество рыбок данио в клинике Майо сыграло важную роль в создании этой модельной системы во всем мире. Преподаватели Mayo разрабатывают рыбок данио для моделирования сердечных заболеваний у взрослых. Преподаватели Мэйо также разработали первую стратегию целевого ингибирования генов на основе последовательностей, открыв дверь для обращения вспять генетических подходов к рыбкам данио, которые буквально развернуты в каждой рыбной лаборатории в мире.Совместная работа с факультетом рыбок данио Mayo является пионером новых стратегий инсерционного мутагенеза для прямого генетического скрининга.

    Эти инструменты позволили международным исследователям рыбок данио идентифицировать новые гены человека, необходимые для развития крови из гемопоэтических стволовых клеток, формирования кровеносных сосудов, таких органов, как почки и сердце, и, недавно, в спецификации различий пигментов, связанных с человеческая раса. Сообщество рыбок данио Майо служит центром для размещения этого немлекопитающих позвоночных в местных и международных лабораториях для понимания как нормального развития, так и болезней.

    Объект Mayo Zebrafish Facility играет важную роль в нескольких исследовательских лабораториях, выступая в качестве важного центра для новых ученых, которые учатся использовать потенциал этой модельной системы. Объект служит важным координационным центром для обучения других лабораторий, студентов и приглашенных ученых. На сегодняшний день исследователи Mayo из семи различных отделов/подразделений являются членами текущего пула пользователей. Новые разрабатываемые области напрямую влияют на уход за пациентами, особенно в области лечения никотиновой зависимости.

    Научные и технические знания, представленные факультетом данио в Мэйо, представляют собой международно признанный ресурс, а Стивен Эккер, доктор философии, является главным редактором основного журнала в этой области, Zebrafish. Поддерживая глобальный охват, Zebrafish Facility является основным местным научным ресурсом для экспертизы данио, чье видение полностью соответствует более широкому видению предоставления лучшего в мире медицинского обслуживания в Mayo Clinic.

    .

    Центр рыб данио – молекулярные и биомедицинские науки

    Предприятие для рыбы данио

    Рыбки данио использовались в качестве модели эмбриогенеза более 100 лет в основном потому, что оплодотворение и развитие являются внешними, а эмбрионы оптически прозрачны и с ними легко манипулировать. Короткое время генерации, простота мутагенеза и большие кладки за одно спаривание делают их также удобной модельной системой для генетической работы.

    Существует несколько высоко гомологичных штаммов рыбок данио, и установлены общие методы получения новых штаммов и мутантов, во многом благодаря возможности искусственно создавать и идентифицировать мутанты в одном поколении, идентифицировать изогенные запасы, криоконсервировать гаметы и генерировать трансгенных рыб.

    В настоящее время осуществляется инициатива по геномике рыбок данио, цель которой состоит в том, чтобы создать ресурсы для облегчения картирования и позиционного клонирования генов у рыбок данио, в частности, для создания генетической карты с разрешением 0,3 сМ или выше, для разработки выраженных метки последовательности (EST) из существующих и новых библиотек кДНК с указанием конкретных моментов времени развития и тканей, а также для создания карты физического или радиационного гибрида (RH). Прогнозируется, что к 2002 году будет завершен проект генома рыбок данио, в котором будет секвенирован полный геном.

    Хема де Патрисио Менеджер по эксплуатации

    Центр рыб данио расположен в Хитчнер-холле и оснащен системой выращивания рыбы в водной среде для ускоренных биоисследований (AHAB) (водная среда обитания, Апопка, Флорида). Эта система состоит из пятиуровневых стеллажей из нержавеющей стали шириной пять футов, в которых используется любая комбинация резервуаров трех размеров (9, 2,75, 1 литр). Линии подачи воды подают стерилизованную УФ-излучением воду в каждый резервуар через независимый клапан. Аквариумы имеют самоочищающееся дно, а система слива имеет оптически прозрачную конструкцию.Система фильтрации требует минимального обслуживания и поддерживает высокое качество воды, значительно снижая заболеваемость и смертность.

    Резервуары для рыбок данио

    Объект содержит 12 рециркуляционных стеллажей с резервуарами для генетических и опытно-конструкторских работ и один физически изолированный стеллаж с проточным резервуаром для исследований болезней и токсикологии, всего почти 800 резервуаров, что позволяет вместить более 30 000 рыбок данио.

    Щелкните здесь, чтобы просмотреть видеоролик QuickTime о эмбрионе рыбки данио.

    СФАРИ | Модели рыбок данио

    Рыбок данио все чаще используют для изучения нарушений развития нервной системы, включая расстройство аутистического спектра (РАС). Рыбки данио генетически податливы, прозрачны во время развития и поддаются высокопроизводительному фенотипированию, что делает их ценной экспериментальной платформой для изучения биологических механизмов, с помощью которых генетические мутации влияют на фенотип, и для выявления потенциальных терапевтических мишеней.

    Однако использование мутантных рыбок данио для изучения функции генов оказалось затруднительным.Одна из причин заключается в том, что генетические манипуляции, направленные на потерю функции гена, могут все еще оставлять значительное количество мРНК, продуцируемой геном-мишенью, указывая на то, что потеря функции гена-мишени не может быть полностью достигнута 1 .

    Чтобы решить эту проблему и облегчить исследования РАС с использованием рыбок данио, SFARI в настоящее время курирует линии рыбок данио с мутациями в паралогах рыбок данио генов риска РАС, в которых потеря функции гена подтверждается путем прямого измерения уровней мРНК или белка (при наличии антител). а не через оценку фенотипа.К ним относятся ранее существовавшие линии рыбок данио, а также линии, которые были депонированы и/или проверены по запросу SFARI, а также линии, которые были созданы и проверены de novo при поддержке SFARI.

    Все линии, курируемые SFARI, перечислены ниже и могут быть найдены в Международном исследовательском центре Zebrafish (ZIRC). Заинтересованные исследователи должны связаться с ZIRC напрямую, чтобы получить доступ.

    АРИД1Б

    Аллель ZIRC: y607
    Создано: Гарольд Берджесс (Национальный институт детского здоровья и развития человека)
    Метод: CRISPR
    Валидация: количественная полимеразная цепная реакция (КПЦР)

    ЧД8 Аллель ZIRC: y608
    Создано: Гарольд Берджесс (Национальный институт детского здоровья и развития человека)
    Метод: CRISPR
    Валидация: количественная полимеразная цепная реакция (КПЦР)

    ДИНЦ1х2 Аллель ZIRC: mw20
    Создано: Брайан Линк (Медицинский колледж Висконсина) 2
    Метод: Химический мутагенез
    Валидация: полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР)

    ФМР1 Аллель ZIRC: hu2787
    Создатель: Рене Ф.Кеттинг (Университетский медицинский центр Утрехта) 3
    Метод: N-этил-N-нитрозомочевина ( ENU ) мутагенез
    Валидация: Вестерн-блоттинг, иммуноцитохимия Аллель ZIRC: hu2898
    Создано/описано: Рене Ф. Кеттинг, доктор философии. (Университетский медицинский центр Утрехта) 3
    Метод: ENU мутагенез
    Валидация: Вестерн-блоттинг, иммуноцитохимия

    MECP2 Аллель ZIRC: fh332
    Создано/описано: Сесилия Моэнс, Ph.D. (Центр исследования рака Фреда Хатчинсона) 4
    Метод: мутагенез ЕНУ
    Валидация: вестерн-блот

    MEF2C Аллель ZIRC: b1086
    Создано/описано: Чарльз Киммел (Университет Орегона) 5
    Метод: мутагенез ЕНУ
    Валидация: Иммуногистохимия Аллель ZIRC: fh388
    Создано/описано: Сесилией Моэнс (Центр исследования рака Фреда Хатчинсона) 6
    Метод: мутагенез ЕНУ
    Валидация: Иммуногистохимия

    ПТЭН Аллель ZIRC: hu1864
    Создано: Jeroen den Hertog, Ph.Д. (Лейденский университет) 7
    Метод: мутагенез ЕНУ
    Валидация: вестерн-блот Аллель ZIRC: hu1435
    Создано: Jeroen den Hertog, Ph.D. (Лейденский университет) 7
    Метод: мутагенез ЕНУ
    Валидация: вестерн-блот

    SCN1A/SCN2A Аллель ZIRC: y609
    Создано: Гарольд Берджесс (Национальный институт детского здоровья и развития человека)
    Метод: CRISPR
    Валидация: количественная полимеразная цепная реакция (КПЦР)

    Ожидается, что в 2021 году будут доступны следующие линии:

    • CNTNAP2
    • ДЫРК1А
    • ГРИН2Б
    • NRXN1
    • ХВОСТ3
    • СИНГАП1

    Для получения дополнительной информации об этих линиях и общих вопросов об экспериментальных моделях SFARI обращайтесь по адресу: [email protected]орг.

    Ядро рыбки данио | BIDMC Бостона

    О основном объекте BIDMC Zebrafish


    Основной объект BIDMC Zebrafish Core Facility — это недавно спроектированный комплекс на более чем 3000 аквариумов, расположенный в здании Slosberg-Landay. Это современное сооружение площадью 2500 кв. футов, построенное компанией Pentair Aquatic Habitats. Учреждение оборудовано 48 стеллажами, в которых размещаются аквариумы для взрослых рыбок данио стандартного размера, три стеллажа для питомника для личинок рыб и карантинное помещение с двумя автономными системами содержания.Линии дикого типа поддерживаются внутри компании для общего пользования. Влажное лабораторное пространство доступно для разведения и обслуживания линии; основной персонал и техники, связанные с учреждением, осуществляют ежедневное кормление. Ядро включает в себя специальный процедурный кабинет для манипуляций с эмбрионами. С 2011 года на объекте работает штатный менеджер, который может помочь с доступом, обучением и общими вопросами содержания рыбок данио. Все пользователи BIDMC Zebrafish Core должны быть связаны с одобренным IACUC протоколом для животных.

    Услуги

     

    • Содержание и общий уход за рыбками данио (кормление, наблюдение за здоровьем, обслуживание системы)
    • Размножение рыбок данио дикого типа для производства эмбрионов
    • Обучение обращению с рыбками данио и их содержанию
    • Помощь в планировании и подготовке протокола данио
    • Доставка и получение живых рыбок данио
    Оборудование
    • 3000 баков Система оборотного водоснабжения Aquatic Habitats (баки 1, 5, 10 л), включая питомник
    • 2 автономных изолятора/карантина
    • 4 Посудомоечные машины Labconco с пароочистителем
    • 4 микроинжектора Narishige
    • 4 стереомикроскопа Leica
    • 1 Высокочастотный ультразвуковой аппарат Vevo800
    • 2 инкубатора с регулируемой температурой
    • 4 Вибростабилизированные станции микроинъекции
    • 3 Мониторы качества воды YSI 5200
    • 3 монитора PT4 TGP
    Доступ и использование

    ВСЕ пользователи должны:

    • Быть включенным в одобренный IACUC протокол животных (для рыбок данио)
    • Пройдите обучение правилам и стандартным операциям BIDMC Core Facility до получения доступа к карте
    • Проведение обучения BIDMC ARF и CITI в соответствии с использованием рыбок данио
    • Иметь допуск BIDMC для работы с животными
    • Гуманно работать с экспериментальными линиями рыбок данио, следуя утвержденным IACUC стандартным процедурам плотности посадки и обслуживания аквариума (см. СОП)
    • Участие в чередовании кормления в выходные и праздничные дни
    Плата за структуру
    • Внутренняя ставка BIDMC: 175 долларов США.00 за стойку в месяц
    • Внешний академический: 200 долларов США за стойку в месяц

    Плата за питомник/карантин : 200,00 долларов США за использование объекта, ежемесячно
    Плата за техническое обслуживание дикого типа : 200,00 долларов США за использование объекта, ежемесячно
    Плата за техническое обслуживание* : 30,00 долларов США за фиксированную плату в месяц при условии предоставления объекта (*отменяется, если отменяется, если он предоставляется)

    Связаться с

    Основной координатор
    Надин Будроу
    Тел.: 617-667-8943
    Электронная почта: [email protected]

    .

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.